违反村集体组织章程的股权转让效力需分情况讨论，核心在于章程条款性质及是否损害第三方利益，具体如下：

1. 章程条款为“管理性强制规范”时，转让有效但可能需补正程序
   若章程仅规定“股权转让需经村委会备案”或“需提前30日通知其他成员”等程序性要求，此类条款属于管理性规范。此时即使未履行程序，股权转让合同本身仍有效，但转让方可能需承担违约责任（如支付违约金），或需补办手续使转让行为对内对外均生效。
   法律依据：根据《民法典》第143条，合同效力取决于行为能力、真实意思表示、不违法违规三要素，程序瑕疵不影响合同效力。

2. 章程条款为“效力性强制规范”时，转让可能无效
   若章程明确规定“本村成员外不得受让股权”或“股权转让需经全体成员2/3以上同意”，此类条款属于效力性规范。此时违反章程的转让行为可能因“违反法律、行政法规的强制性规定”或“违背公序良俗”被认定无效（《民法典》第153条）。
   例外情形：若转让行为已实际履行（如完成工商变更、实际分红），且其他成员长期未提出异议，可能因“事实履行”或“表见代理”被推定为有效，但需结合具体证据判断。

3. 涉及第三方利益时，需优先保护善意相对人
   若股权已转让给不知情的第三方（如非本村成员），且第三方已支付合理对价并实际占有股权，此时可能适用“善意取得”制度（《公司法司法解释三》第25条）。即使转让违反章程，第三方仍可取得股权，但原股东需对村集体承担违约责任。

实务建议：

• 转让前务必核查章程条款性质，区分管理性规范与效力性规范；
  
• 若章程限制严格，建议提前与村集体协商修改章程或取得书面同意；
  
• 转让后及时办理备案、变更登记等手续，避免程序瑕疵导致权利不稳定。
  

如有具体章程条款或转让细节需要分析，可直接向我提供材料，我会进一步结合案例为您解读。