结论：上班第三天迟到是否算旷工，需结合公司规章制度、劳动合同及迟到具体情况综合判断，不能一概而论。以下从不同角度详细分析：
一、公司规章制度与劳动合同的约定
规章制度明确规定：
- 若公司规章制度中明确规定了迟到的定义、处理方式及旷工的认定标准，且该规章制度已通过合法程序（如民主程序制定、公示或告知员工）成为劳动合同的一部分，则迟到是否构成旷工应依据该规定执行。
- 例如：规章制度规定“迟到超过30分钟视为旷工半天”，则员工上班第三天迟到超过30分钟，即可按旷工半天处理。
劳动合同有特别约定：
- 劳动合同中可能包含对迟到、旷工的特别约定，如迟到次数达到一定标准即视为旷工等。此类约定若不违反法律法规的强制性规定，且双方自愿签署，则具有法律效力。
- 例如：劳动合同约定“一个月内迟到三次及以上视为旷工一天”，则员工上班第三天迟到，若此前已有两次迟到记录，即可按旷工一天处理。
二、迟到具体情况与旷工的认定
迟到时间的长短：
- 旷工通常指员工无正当理由未到岗工作或未按规定时间到岗且未履行请假手续的行为。迟到时间的长短是判断是否构成旷工的重要因素之一。
- 例如：若员工仅迟到几分钟，且未对公司正常工作秩序造成严重影响，一般不宜直接认定为旷工。
迟到的原因与主观故意：
- 迟到的原因（如交通拥堵、突发疾病等）及员工的主观故意（如故意拖延时间、无视公司规定等）也是判断是否构成旷工的考虑因素。
- 例如：若员工因不可抗力（如自然灾害、交通事故等）导致迟到，且及时与公司沟通并说明情况，一般不宜认定为旷工。
三、法律建议与风险提示
查阅公司规章制度与劳动合同：
- 员工应仔细查阅公司规章制度及劳动合同中关于迟到、旷工的约定，了解自己的权利与义务。
及时与公司沟通：
- 若因特殊原因导致迟到，员工应及时与公司沟通并说明情况，争取公司的理解与宽容。
保留证据：
- 员工应保留与迟到相关的证据（如交通票据、医院诊断证明等），以备不时之需。
风险提示：
- 若公司规章制度或劳动合同中关于迟到、旷工的约定存在不合理或违法之处（如规定迟到一次即视为旷工一天等），员工有权提出异议并寻求法律援助。
- 若公司无正当理由将员工迟到认定为旷工并据此进行处罚（如扣发工资、解除劳动合同等），员工可依法维护自己的合法权益。
总结：上班第三天迟到是否算旷工，需根据具体情况综合判断。员工应了解公司规章制度及劳动合同中的相关约定，及时与公司沟通并保留相关证据。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。