回迁房指标买卖协议是否受法律保护，主要取决于协议的签订是否符合法律法规的规定以及房屋的具体产权状况。以下是对此问题的详细分析：
一、协议有效的情况
合同主体具有民事行为能力：
- 签订回迁房指标买卖协议的双方（如回迁户和购买方）必须是具有完全民事行为能力的主体。这意味着双方应能够理解协议的内容，并自愿承担协议约定的权利和义务。
意思表示真实：
- 双方在签订协议时的意思表示必须真实，不存在欺诈、胁迫、重大误解等情形。例如，回迁户应如实告知购买方回迁房的具体情况，包括产权状况、交付时间等，购买方也应在充分了解后自愿签订协议。
内容合法且不违背公序良俗：
- 协议内容必须符合法律法规的规定，不得违反关于房屋建设、产权登记等方面的强制性规定，也不得包含违背社会公德、损害公共利益的条款。例如，协议中不得约定非法转让土地使用权或规避税收等违法内容。
协议形式符合要求：
- 回迁房指标买卖协议建议采用书面形式，并由双方签字或盖章确认。书面形式有助于明确双方的权利义务，避免纠纷发生时口说无凭。
产权清晰或预期清晰：
- 如果回迁房已经取得或预期能够取得房产证，且产权归属明确无争议，那么买卖协议通常是受法律保护的。因为房产证是房屋产权的法定证明，拥有房产证意味着房屋产权明确。
二、协议效力存在瑕疵或无效的情况
出卖人未取得处分权：
- 如果回迁房的产权人并非签订协议的出卖人，或者出卖人没有得到产权人的合法授权就签订协议出售回迁房指标，该协议可能效力待定甚至无效。因为出卖人无权处分他人的财产。
违反土地性质相关规定：
- 如果回迁房的土地性质为集体土地，且不符合相关集体土地房屋交易的规定（如未满足本集体经济组织成员内部流转等条件），则对外签订的买卖协议可能因违反法律规定而无效。因为集体土地上的房屋交易受到特定限制。
恶意串通损害他人利益：
- 买卖双方恶意串通，签订协议损害第三人利益（如为了逃避债务而虚假签订回迁房指标买卖协议转移财产），该协议无效。因为恶意串通损害他人利益的行为违反了法律法规的强制性规定。
未取得或预期无法取得房产证：
- 如果回迁房未取得或预期无法取得房产证，或者存在产权纠纷（如产权归属不明确、涉及多个权利人争议等），那么买卖协议可能因违反相关法律法规的规定或者损害社会公共利益等而被认定为无效或者效力待定。因为无法取得房产证的房屋在法律上无法确认其产权归属。
三、注意事项与建议
谨慎审查协议内容：
- 在签订回迁房指标买卖协议时，应仔细审查协议条款，确保双方的权利和义务明确无误。特别是关于房屋交付时间、付款方式、产权过户等关键条款应详细约定。
核实产权状况：
- 在交易前务必核实回迁房的产权状况，包括是否已取得房产证、是否存在产权争议等。如果可能的话，可以要求出卖人提供相关的产权证明文件或查询房屋产权登记信息。
了解当地政策：
- 不同地区对于回迁房买卖的具体规定可能存在差异。一些地方可能对回迁房的上市交易时间、条件等有明确限制。因此，在签订协议前应了解并遵守当地的相关规定。
寻求法律帮助：
- 如果对回迁房指标买卖协议的法律效力存在疑虑或遇到复杂的法律问题，建议直接向我咨询。我可以根据具体情况提供专业的法律意见和帮助。
综上所述，回迁房指标买卖协议是否受法律保护取决于多个因素的综合考量。在签订协议时，应谨慎对待并确保协议的合法性和有效性，以维护自身的合法权益。