在总承包合同中，公章和合同章均具有法律效力，但具体使用哪种章，需根据合同内容、公司规定及实际交易习惯来综合判断。以下是对此问题的详细分析：
一、公章与合同章的法律效力
公章：公章是公司权力的象征，代表公司的正式意志。在合同上加盖公章，通常意味着公司对合同内容的认可和承担相应法律责任。公章的使用范围广泛，包括但不限于合同签订、文件发布、对外承诺等。
合同章：合同章是专门用于合同签订的印章，它同样具有法律效力。在合同上加盖合同章，表明公司愿意按照合同约定履行义务并享受权利。合同章的使用通常更专注于合同领域，是公司对外签订合同的一种常见方式。
二、选择使用公章还是合同章的考虑因素
合同内容：如果合同内容涉及公司重大利益或具有长期性、复杂性，使用公章可能更为稳妥，以体现公司对合同的重视和正式态度。如果合同内容相对简单、明确，且交易习惯中常用合同章，则使用合同章也是可行的。
公司规定：不同公司可能有不同的印章使用规定。有些公司可能明确规定在签订总承包合同时必须使用公章，而有些公司则可能允许使用合同章。因此，在使用印章前，应查阅公司相关规定或咨询公司法务部门。
实际交易习惯：在实际交易中，不同行业、不同地区可能存在不同的交易习惯。有些行业或地区可能更倾向于使用公章签订合同，而有些则可能更习惯于使用合同章。了解并遵循实际交易习惯，有助于减少合同纠纷和误解。
三、法律建议
明确印章使用规定：在签订总承包合同前，应明确公司关于印章使用的规定，确保使用正确的印章。如果公司规定不明确或存在争议，应及时咨询公司法务部门或相关法律专业人士。
注意印章保管与使用安全：无论使用公章还是合同章，都应确保印章的保管与使用安全。避免印章被盗用、滥用或遗失等情况发生，以免给公司带来不必要的法律风险和经济损失。
完善合同条款与审查流程：除了正确使用印章外，还应完善合同条款和审查流程。确保合同内容明确、合法、有效，并经过公司相关部门的审查和批准。这有助于降低合同纠纷的风险，保护公司的合法权益。
在总承包合同的签订过程中，选择使用公章还是合同章需根据具体情况来综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。