您好，针对您提出的“个人申请工伤认定书后协商好了怎么办”这一问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，当您个人已经申请了工伤认定书，并且随后与用人单位进行了协商并达成了和解协议，这一协议在双方自愿、平等且不违反法律法规的前提下，是具有法律效力的。这意味着，一旦协议达成并履行，双方都应当遵守协议内容，不得随意反悔或变更。
然而，也存在一些特殊情况，您可能需要考虑是否要撤销或变更之前的和解协议。这主要取决于协议签订时是否存在以下情形：
重大误解：如果您在签订协议时对工伤的赔偿项目、金额或自身伤势程度存在重大误解，导致您做出了不真实的意思表示，那么您有权请求撤销该协议。
显失公平：如果协议约定的赔偿金额明显低于您按照工伤保险待遇赔偿标准计算应获得的金额，且这种差异显著到违背了公平原则，那么您同样有权请求撤销该协议。
欺诈、胁迫或乘人之危：如果用人单位在签订协议时存在欺诈、胁迫或利用您处于危困状态、缺乏判断能力等情形，迫使您签订了不公平的协议，那么您也有权请求撤销。
具体操作建议：
评估协议内容：首先，您需要仔细评估和解协议的内容，包括赔偿项目、金额以及双方的权利义务等，确保协议内容公平合理。
咨询专业人士：如果您对协议内容存在疑问或不确定，建议咨询专业的劳动法律师或相关机构，以获取更准确的法律意见。
考虑后续治疗费用：在签订和解协议时，您还需要充分考虑后续可能产生的治疗费用以及是否构成伤残等级等不确定因素。如果可能，建议委托专业的鉴定机构进行伤残鉴定，并依据鉴定意见及其他相关证据来全面、合理地主张各项损失赔偿。
遵守诚信原则：如果协议内容公平合理且您已经自愿签订并履行了协议，那么建议您遵守诚信原则，不再随意反悔或变更协议内容。否则，您可能会面临法律纠纷和信誉损失。
案例参考：
在江苏省南通市通州区人民法院审理的一起劳动争议纠纷中，劳动者在签订和解协议并获得赔偿后反悔再次申请工伤认定并起诉要求撤销协议，但法院最终认定协议真实有效并驳回了劳动者的诉讼请求。这强调了诚信原则在劳动争议处理中的重要性。
而在湖南省石门县人民法院审理的另一起案件中，由于和解协议签订时劳动者的工伤认定和伤残等级鉴定结论均未作出，且协议约定的赔偿金额明显低于法定标准，因此法院判决撤销了该协议并要求用人单位追加赔偿。这说明了在特定情形下劳动者有权请求撤销不公平的和解协议。
综上所述，当您个人申请工伤认定书后与用人单位协商好了，您需要仔细评估协议内容并考虑后续可能产生的因素。如果协议内容公平合理且您已经自愿签订并履行了协议，那么建议您遵守诚信原则；如果协议存在重大误解、显失公平等情形，那么您有权请求撤销或变更协议。在处理此类问题时，建议您咨询专业人士以获取更准确的法律意见。