如果工程款没有回到对公账户，且该对公账户已经不存在了，可能会面临以下几种情况和后果：

1. 资金流向不明，可能引发法律纠纷：

   • 工程款未回到对公账户，首先面临的问题是资金流向的合法性。如果这笔款项被挪用或用于非合同约定的用途，可能构成违约或违法行为，引发与业主、承包商或其他相关方的法律纠纷。
   • 对公账户的注销可能使得资金流向更加难以追踪，增加了解决纠纷的难度。在法律程序中，资金流向的证明是关键证据之一，账户注销可能导致无法提供有效的资金流向证明。

2. 税务合规风险：

   • 工程款未回到对公账户，可能涉及税务合规问题。根据税法规定，企业应通过其对公账户进行资金往来，以确保税务申报的准确性和合规性。
   • 如果工程款未通过正规渠道回到对公账户，而是进入了个人账户或其他非正规渠道，可能面临税务部门的调查和处罚，包括补缴税款、滞纳金和罚款等。

3. 影响企业信誉和融资能力：

   • 工程款未回到对公账户且账户注销，可能对企业的信誉产生负面影响。这可能使得潜在客户或合作伙伴对企业的财务状况和诚信度产生质疑，从而影响企业的业务发展和市场竞争力。
   • 此外，银行和其他金融机构在评估企业融资申请时，通常会关注企业的资金往来和账户状况。如果工程款未回到对公账户且账户已注销，可能影响企业的融资能力和融资成本。

4. 法律责任和后果：

   • 根据相关法律法规，企业应确保资金往来的合法性和合规性。如果工程款未回到对公账户且账户已注销，企业可能面临法律责任，包括但不限于行政处罚、民事赔偿和刑事责任等。
   • 具体法律责任和后果取决于多种因素，如资金金额、资金用途、是否涉及欺诈或违法行为等。因此，在面临这种情况时，企业应尽快咨询专业律师，以了解具体的法律责任和后果，并采取相应的法律措施。

建议措施：

• 立即咨询专业律师：在面临工程款未回到对公账户且账户已注销的情况时，企业应立即咨询专业律师，以了解具体的法律责任和后果，并获取专业的法律建议。
• 配合调查和提供证据：如果面临税务部门或其他相关部门的调查，企业应积极配合，并提供必要的证据和资料，以证明资金往来的合法性和合规性。
• 加强内部管理和合规培训：企业应加强内部管理，确保资金往来的合法性和合规性。同时，定期对员工进行合规培训，提高员工的合规意识和风险防范能力。

如有任何进一步的问题或需要更具体的法律建议，请直接向我咨询。