核心结论：养殖场未办理设施农用地手续属于违规用地行为，需根据实际情况采取补救措施或承担法律责任。以下是具体分析及建议：
1. 法律性质与风险
根据《土地管理法》《自然资源部农业农村部关于设施农业用地管理有关问题的通知》等规定，设施农用地需经乡镇政府申报、县级自然资源部门备案后方可使用。未办理手续可能面临以下风险：
- 行政处罚：自然资源部门可责令限期改正，逾期不改正的，可能被认定为非法占地，面临罚款（每平方米100-1000元）、拆除地上建筑物等处罚。
- 停产风险：若养殖场涉及环保、动物防疫等合规问题，未办理用地手续可能成为政府要求停产整顿的连带理由。
- 补偿障碍：若遇征收拆迁，未备案的设施农用地可能无法获得合法补偿，仅能主张实际损失（如建筑物成本）。
2. 补救措施与流程
若养殖场符合设施农用地条件（如用于畜禽养殖、水产养殖等生产设施及辅助设施）：
- 立即补办手续：
- 向乡镇政府提交用地申请，说明用地位置、面积、用途等；
- 乡镇政府审核后报县级自然资源部门备案，部分地区需同步办理乡村建设规划许可；
- 备案后签订用地协议，明确土地复垦义务。
- 配合整改：若已建成但未备案，需主动拆除违规部分（如超出备案范围的建筑）或补办超占部分手续。
若养殖场不符合设施农用地条件（如占用永久基本农田、生态保护红线等）：
- 需停止违规行为，恢复土地原状；
- 若涉及耕地“非农化”“非粮化”，可能面临更严厉处罚，建议咨询律师评估整改方案。
3. 特殊情形处理
- 历史遗留问题：若养殖场建于2019年《关于设施农业用地管理有关问题的通知》发布前，可向当地自然资源部门申请“历史遗留问题处理”，部分地区允许补办手续或缴纳罚款后合法化。
- 政策过渡期：部分省份对2020年后新建的养殖场放宽备案要求（如“先建后补”），需核实当地政策。
4. 法律建议
- 尽快自查：核对土地性质（通过当地自然资源部门官网或现场查询）、用地范围是否超出备案面积。
- 咨询专业律师：若涉及复杂情况（如土地纠纷、行政处罚争议），可委托律师协助与政府部门沟通、申请听证或提起行政复议/诉讼。
- 合规经营：未来用地前务必办理备案手续，避免因程序瑕疵影响养殖场存续。
提示：设施农用地政策具有地域性，具体操作需以当地自然资源部门要求为准。如有疑问，可直接向我咨询，我会结合您所在省份的政策提供针对性建议。