结论：商品房认购三年才通知签合同，合同是否有效不能一概而论，需结合具体情况判断。以下从不同角度进行分析：
一、合同效力的一般判断
合同成立与生效的基本原则：
- 合同成立通常要求双方意思表示一致，即要约与承诺的达成。在商品房认购中，认购书往往被视为预约合同，其目的在于为将来签订正式的商品房买卖合同做准备。
- 合同生效则要求合同内容合法、形式合规，且双方具备相应的民事行为能力。若认购书及后续签订的正式合同均满足这些条件，则合同原则上有效。
延迟通知签合同的影响：
- 延迟通知签合同本身并不直接导致合同无效。关键在于延迟通知是否违反了认购书中的约定或相关法律法规的规定，以及是否对购房者的权益造成了实质性损害。
- 如果认购书中明确规定了签订正式合同的时间或条件，而开发商未按时通知，则可能构成违约，购房者有权要求开发商承担违约责任。但这并不直接等同于合同无效。
二、可能影响合同效力的特殊情况
认购书中的约定：
- 如果认购书中明确约定了“若开发商未在规定时间内通知购房者签订正式合同，则认购书自动失效”或类似条款，那么延迟通知可能导致认购书失效，进而影响后续正式合同的签订和效力。
- 反之，如果认购书中未对此进行明确约定，则延迟通知通常不会直接导致合同无效。
法律法规的规定：
- 根据《民法典》等相关法律法规，合同无效的情形主要包括：无民事行为能力人实施的民事法律行为、虚假的意思表示、违反法律或行政法规的强制性规定、违背公序良俗等。
- 延迟通知签合同通常不属于上述无效情形之一。但是，如果延迟通知导致购房者无法在合理时间内行使权利或履行义务，且这种延迟是开发商故意或重大过失造成的，购房者可能可以依据相关法律法规主张开发商承担相应责任。
购房者权益的实质性损害：
- 如果延迟通知导致购房者错过了购房的最佳时机、房价大幅上涨或下跌等，且这种损害是开发商能够预见或应当预见的，购房者可能可以主张开发商赔偿因此造成的损失。
- 然而，这种损害赔偿请求并不直接等同于合同无效。购房者仍需根据合同约定和法律法规的规定来主张自己的权益。
三、法律建议
审查认购书内容：
- 购房者应仔细审查认购书中的各项条款，特别是关于签订正式合同的时间、条件以及违约责任等方面的约定。
与开发商协商：
- 如果购房者认为延迟通知签合同对其造成了不利影响，可以尝试与开发商进行协商，寻求双方都能接受的解决方案。
寻求法律帮助：
- 如果协商无果或购房者认为自己的权益受到了严重侵害，可以寻求专业律师的帮助，通过法律途径来维护自己的权益。
总结：商品房认购三年才通知签合同，合同是否有效需根据认购书的约定、法律法规的规定以及购房者权益是否受到实质性损害等因素进行综合判断。购房者应仔细审查合同条款，与开发商协商解决争议，并在必要时寻求法律帮助。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。