您好，关于司法机关如何赔偿的问题，这主要涉及到司法赔偿的赔偿义务机关确定以及赔偿标准两个方面。下面我将为您详细解答：

一、司法赔偿的赔偿义务机关确定

在司法赔偿案件中，赔偿义务机关是指代表国家接受赔偿请求并支付赔偿费用的机关。其确定主要依据不同的司法侵权行为主体及具体情形：

1. 刑事赔偿：

   • 错误拘留：由作出拘留决定的机关，如公安机关或人民检察院，作为赔偿义务机关。
   • 错误逮捕：由作出逮捕决定的机关，如检察院或法院（在自诉案件中），负责赔偿。
   • 再审改判无罪：由作出原生效判决的人民法院承担赔偿责任。
   • 二审改判无罪或发回重审后作无罪处理：一审法院为赔偿义务机关。

2. 民事诉讼、行政诉讼中的赔偿：

   • 若人民法院在民事诉讼、行政诉讼过程中违法采取强制措施、保全措施或执行错误，造成损害的，该人民法院即为赔偿义务机关。

3. 司法工作人员个人侵权：

   • 若司法工作人员在执行职务过程中违法行使职权，造成公民、法人或其他组织人身权、财产权损害的，该工作人员所在的机关应承担赔偿责任。

二、司法赔偿标准

司法赔偿标准主要依据《国家赔偿法》的相关规定，具体包括以下几个方面：

1. 人身自由权损害赔偿：

   • 每日赔偿金按国家上年度职工日平均工资计算。例如，若某年度国家职工日平均工资为300元，则非法拘禁10天的赔偿金为3000元。

2. 生命健康权损害赔偿：

   • 造成身体伤害：支付医疗费、护理费及误工减少的收入，最高额为国家上年度职工年平均工资的5倍。
   • 造成部分或全部丧失劳动能力：根据伤残等级支付残疾赔偿金，最高可达国家上年度职工年平均工资的20倍；对扶养的无劳动能力者还需支付生活费。
   • 造成死亡：支付死亡赔偿金和丧葬费，总额为国家上年度职工年平均工资的20倍；对死者生前扶养的无劳动能力者支付生活费至其具备劳动能力或死亡。

3. 财产权损害赔偿：

   • 处罚款、罚金、追缴等错误决定：返还财产。
   • 查封、扣押、冻结财产造成损坏或灭失：恢复原状或按直接损失给予赔偿。
   • 应当返还的财产损坏：能恢复原状的恢复原状，不能恢复的按损害程度给付相应赔偿金。
   • 应当返还的财产灭失：给付相应赔偿金。
   • 吊销许可证和执照、责令停产停业：赔偿停产停业期间必要的经常性费用开支。
   • 对财产权造成其他损害：按直接损失给予赔偿。

4. 精神损害赔偿：

   • 适用情形：致人精神损害且造成严重后果。
   • 赔偿方式：消除影响、恢复名誉、赔礼道歉，并支付相应的精神损害抚慰金。

三、赔偿程序

1. 申请条件：

   • 申请人需具有请求权。
   • 需有明确的赔偿义务机关。
   • 属于法定赔偿范围和受理法院管辖。
   • 需在法定期限内提出（一般为两年）。

2. 申请材料：

   • 赔偿申请书。
   • 生效法律文书或相关证明材料。
   • 证明侵权行为存在的材料。
   • 其他必要证据。

3. 处理流程：

   • 立案审查：法院在收到申请后7日内决定是否立案。
   • 审理阶段：立案后6个月内审结，复杂案件可延长6个月。
   • 执行环节：作出赔偿决定后10日内送达赔偿请求人。

综上所述，司法机关的赔偿主要依据侵权行为主体、具体情形以及《国家赔偿法》的相关规定来确定赔偿义务机关和赔偿标准。希望这些信息能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的解释，请随时告诉我。