单纯的无证驾驶电动摩托车行为一般不会留下案底，但会作为违法记录在公安交管部门系统中留存。若因无证驾驶导致严重交通事故并构成犯罪，则可能会被追究刑事责任，进而留下案底。以下是对此问题的详细分析：

一、无证驾驶电动摩托车的法律性质

无证驾驶电动摩托车，通常属于违反《中华人民共和国道路交通安全法》的一般违法行为。根据该法第九十九条的规定，未取得机动车驾驶证驾驶机动车的，由公安机关交通管理部门处二百元以上二千元以下罚款，可以并处十五日以下拘留。这里的“机动车”包括电动摩托车，如果其设计最高时速、空车质量、外形尺寸等符合机动车标准。

二、案底的定义与影响

“案底”通常指的是某人过去犯法或犯罪行为的记录，也被称为前科。这种记录会在公安机关、司法机关等留存，并可能对个人的未来产生一定影响，如就业限制、申请特定权利受限等。只有被人民法院判定有罪，才会正式留下犯罪记录，即案底。

三、无证驾驶电动摩托车的处理与案底留存

1. 一般违法行为处理：

   • 对于无证驾驶电动摩托车的违法行为，通常会按照相关交通法规进行行政处罚，如警告、罚款、甚至拘留等。
   • 这些行政处罚的记录和犯罪记录有本质区别，不会形成我们通常所说的案底。但会被记录在公安交管部门的系统中，作为个人的一项违法记录。

2. 特殊情况下的处理：

   • 如果因为无证驾驶电动摩托车导致了严重的交通事故，甚至构成了交通肇事罪（如造成人员伤亡、重大财产损失等），那么这种情况就可能会被追究刑事责任。
   • 一旦构成犯罪并被人民法院判定有罪，就会留下案底。这种案底会伴随个人一生，并可能对本人及子女的某些方面（如报考公务员、参军政审等）产生影响。

四、建议与总结

1. 遵守交通法规：为了避免不必要的麻烦和损失，建议遵守交通法规，不要无证驾驶任何车辆，包括电动摩托车。
2. 了解法律后果：无证驾驶不仅可能面临行政处罚，还可能在发生严重事故时构成犯罪，进而留下案底，对个人未来产生深远影响。
3. 积极配合处理：如不幸涉及此类问题，应积极配合相关部门的调查和处理，并咨询专业法律人士（如我）以获取准确法律意见和帮助。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。