存疑不起诉不会留下犯罪记录。以下是对这一结论的详细解释：
一、存疑不起诉的定义与本质
存疑不起诉，又称证据不足的不起诉，是指检察机关在审查起诉阶段，因犯罪嫌疑人犯罪事实不清、证据不足，经过补充侦查仍然证据不足，不符合起诉条件而作出的不起诉决定。这一决定的本质在于，检察机关根据现有证据无法确切证明犯罪嫌疑人构成犯罪，因此不将其交付审判定罪。这体现了疑罪从无的刑事司法原则，即在没有充分证据证明犯罪的情况下，应推定犯罪嫌疑人无罪。
二、犯罪记录的含义
犯罪记录，通常指的是一个人过去因犯罪行为而被法院判处有罪的相关记录。这些记录是反映个人刑事犯罪前科的重要档案材料，对个人的社会评价、就业、出国等方面可能产生一定影响。
三、存疑不起诉与犯罪记录的关系
不产生犯罪记录：由于存疑不起诉意味着检察机关未将犯罪嫌疑人交付审判定罪，因此不会形成法院的有罪判决。没有法院的有罪判决，犯罪嫌疑人就不会留下犯罪记录。这是存疑不起诉制度对公民合法权益的重要保障。
司法机关档案记录：虽然存疑不起诉不会留下犯罪记录，但在某些情况下，相关记录仍可能会被保留在司法机关的档案中。这些记录主要用于司法机关内部参考，通常不会对个人的日常生活产生实质影响。然而，在特定情况下（如再次涉及法律问题），它们可能会成为司法机关评估案件、判断犯罪嫌疑人社会危险性等因素时的参考依据之一。但即便如此，这些记录也并不等同于犯罪记录，不会对个人产生犯罪记录所带来的负面影响。
四、实际操作中的注意事项
在实际操作中，被存疑不起诉的人有权向公安机关申请开具无犯罪记录证明。尽管个别单位或办事人员可能对存疑不起诉的性质理解不准确，但申请人可以通过提供相关法律规定和必要时请求检察机关出具的不起诉决定书作为证明材料，以顺利开具证明。
五、后续可能的变化
值得注意的是，存疑不起诉并不意味着犯罪嫌疑人就一定没有犯罪行为，而是由于现有证据不足以支持起诉。根据《人民检察院刑事诉讼规则》，如果未来发现新的证据且符合起诉条件，检察机关可以提起公诉。若法院最终作出了有罪判决，那么个人的无犯罪记录证明就需要进行相应的更新或撤销。但这种情况相对较少，且需要严格的法律程序和证据支持。
总结与建议：存疑不起诉是一种体现疑罪从无原则的法律制度，它确保了在证据不足的情况下，犯罪嫌疑人不会被错误地定罪。因此，存疑不起诉不会给犯罪嫌疑人留下犯罪记录。然而，个人在日常生活中仍应遵守法律法规，避免涉及任何违法行为。如果你或你身边的人遇到了存疑不起诉的情况，并对此有进一步的疑问或需要法律帮助，可以直接向我咨询。