结论先行：侵犯知识产权的侵权行为人，在特定情况下确实需要采取方法排除妨碍，这是其应承担的法律责任之一。下面我将从多个角度详细分析这一问题。

一、法律责任的角度

根据我国《民法典》以及知识产权相关法律法规的规定，侵犯知识产权的行为人，除了需要承担停止侵害、赔偿损失等民事责任外，如果其行为已经对权利人的正常使用造成了妨碍，那么侵权行为人还有义务采取必要措施排除这种妨碍。这是为了保障知识产权权利人的合法权益，维护市场的公平竞争秩序。

举例说明：假设某公司未经许可，擅自使用了另一家公司的专利技术进行生产，导致专利权人的市场份额受到严重影响。在这种情况下，专利权人不仅可以要求侵权公司停止使用其专利技术，还可以要求其采取措施（如销毁侵权产品、修改生产工艺等）以排除对专利权人正常使用的妨碍。

二、实际操作的层面

在实际操作中，排除妨碍的具体方式会根据侵权行为的性质、后果以及权利人的需求等因素而有所不同。侵权行为人可能需要与权利人进行协商，共同确定排除妨碍的具体方案；也可能需要接受法院或相关行政部门的裁决，按照裁决内容执行排除妨碍的措施。

法律建议：对于侵权行为人而言，一旦发现自己侵犯了他人的知识产权，应立即停止侵权行为，并主动与权利人沟通，寻求和解或达成赔偿协议。如果权利人要求排除妨碍，侵权行为人应积极配合，按照合理的方式和期限完成排除妨碍的工作，以避免进一步的法律纠纷和损失。

三、法律后果的考量

如果侵权行为人拒绝或未能有效排除妨碍，那么权利人可以通过法律途径追究其法律责任。这可能包括向法院提起诉讼，要求侵权行为人承担民事赔偿责任，甚至可能面临行政处罚或刑事责任（在严重侵犯知识产权的情况下）。

风险提示：侵权行为人应充分认识到排除妨碍是其应尽的法律义务，如果未能履行这一义务，将可能面临严重的法律后果。因此，在侵犯知识产权的情况下，及时采取措施排除妨碍是明智之举。

综上所述，侵犯知识产权的侵权行为人在特定情况下确实需要采取方法排除妨碍。这是其应承担的法律责任之一，也是维护市场公平竞争秩序和保障知识产权权利人合法权益的必要措施。如果您在知识产权方面遇到任何问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。