若专利被无效后，利害关系人已经被执行，可采取以下措施来维护自身权益：

1. 及时申请复审或行政诉讼：

   • 根据《专利法》的相关规定，若专利被宣告无效，利害关系人可以在收到无效宣告请求审查决定书之日起三个月内，向人民法院提起行政诉讼，请求法院撤销该无效决定。这是最直接且有效的救济途径，通过法律程序来争取恢复专利的有效性。
   • 在此过程中，建议尽快收集并整理相关证据，如专利的创造性、新颖性、实用性等方面的证明材料，以及专利被无效前已经产生的经济效益、市场影响力等证据，以支持复审或行政诉讼的请求。

2. 评估执行后果并寻求赔偿：

   • 若专利被无效前，利害关系人已经因专利侵权被执行了赔偿或其他法律责任，那么在专利被无效后，可以评估该执行后果对自身造成的实际损失。
   • 如果认为执行后果不当或过重，可以考虑向执行法院提出执行异议，请求法院重新审查执行行为的合法性和合理性。同时，也可以考虑向原专利权人或其他相关责任方提起民事诉讼，要求其承担因专利无效而给自身造成的损失赔偿责任。

3. 加强后续专利管理和保护：

   • 专利被无效后，应深刻反思专利申请、维护和管理过程中存在的问题和不足，加强后续的专利管理和保护工作。
   • 例如，可以重新评估现有技术的专利性，及时申请新的专利以保护自身的技术创新成果；同时，加强专利的监测和维护工作，及时发现并应对潜在的专利侵权风险。

4. 考虑与原专利权人协商解决：

   • 在某些情况下，与原专利权人进行协商解决可能是一个更为高效和经济的选择。通过协商，双方可以就专利无效后的相关事宜达成一致意见，如赔偿金额、技术转让、合作开发等。
   • 协商解决需要双方保持开放和诚实的沟通态度，寻求互利共赢的解决方案。如果协商成功，可以签订书面协议以明确双方的权利和义务。

在处理此类问题时，还需注意以下法律后果和风险：

• 执行回转的可能性：如果专利被无效后，原执行行为被确认违法或不当，那么执行法院可能会根据申请人的请求进行执行回转，即恢复原状并返还已执行的财产。但这一过程可能较为复杂且耗时较长。
• 诉讼风险和成本：无论是申请复审、提起行政诉讼还是民事诉讼，都需要承担一定的诉讼风险和成本。因此，在决定采取法律行动前，应充分评估自身的诉讼能力和胜诉可能性。
• 商业信誉和市场竞争：专利被无效可能对企业的商业信誉和市场竞争产生一定影响。因此，在处理此类问题时，应综合考虑法律、商业和市场等多方面的因素。

建议利害关系人在遇到此类问题时，及时咨询并委托专业律师进行代理，以确保自身权益得到有效维护。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。