查处烟草专卖违法案件的原则通常遵循一系列法律、法规和程序，以确保执法的公正性、高效性和权威性。这些原则在各地的烟草专卖局制定的相关工作程序中可能有所体现，虽然具体细节可能因地区而异，但核心原则通常包括以下几点：

一、事实清楚、证据确凿

在查处烟草专卖违法案件时，必须确保案件事实清楚，证据确凿。这要求执法人员在调查取证过程中，要全面、客观地收集与案件有关的证据材料，确保证据的真实性、合法性和关联性。只有基于充分且确凿的证据，才能对违法行为进行准确的定性和处理。

二、定性准确

根据收集到的证据，执法人员需要对违法行为进行准确的定性。这要求执法人员熟悉烟草专卖法律法规，能够准确判断违法行为的性质、情节和后果，并依据相关法律法规进行处罚。定性准确是确保执法公正性的重要前提。

三、程序正当

查处烟草专卖违法案件必须遵循正当的法律程序。这包括案件的受理、调查、取证、听证、决定等各个环节，都需要按照法律法规规定的程序进行。程序正当不仅保障了当事人的合法权益，也确保了执法的合法性和有效性。

四、处罚与教育相结合

在查处烟草专卖违法案件时，除了对违法行为进行处罚外，还应注重对当事人的教育。通过处罚与教育相结合的方式，既可以让当事人认识到自己的错误，也可以提高其对烟草专卖法律法规的认识和遵守意识，从而达到预防违法、减少违法行为的目的。

五、高效便民

高效便民是查处烟草专卖违法案件的重要原则之一。这要求执法人员在处理案件时，要尽可能提高办案效率，缩短办案周期，减少当事人的等待时间。同时，也要注重便民服务，为当事人提供便捷、高效的执法服务，增强其对执法工作的满意度和信任度。

六、依法保护当事人权益

在查处烟草专卖违法案件的过程中，必须依法保护当事人的合法权益。这包括保障当事人的知情权、申辩权、听证权等，确保当事人在执法过程中受到公正、公平的对待。对于涉及当事人隐私或商业秘密的信息，执法人员也应依法予以保密。

综上所述，查处烟草专卖违法案件的原则是一个综合性的体系，既包括了对执法公正性、高效性的要求，也体现了对当事人合法权益的保护。在实际工作中，执法人员应严格遵守这些原则，确保执法的合法性和有效性。