针对您提出的“电子书号出版物印纸质书非法出版物案例怎么处理”的问题，这确实是一个涉及出版法规的严肃话题。以下是我根据相关法律法规，为您提供的详细解答：

一、非法出版物的定义与性质

首先，我们需要明确什么是非法出版物。根据《出版管理条例》及相关规定，非法出版物通常指的是未经批准擅自出版、印刷、复制、发行，或者含有国家法律法规禁止内容的出版物。电子书号出版物若未经许可擅自印制成纸质书，且未通过正规出版渠道发行，即构成非法出版物。

二、行政处罚措施

对于出版非法出版物的行为，若尚不构成刑事犯罪，相关部门将依法给予行政处罚，主要包括：

1. 没收与罚款：

   • 出版行政主管部门将没收非法出版的纸质书籍及违法所得。
   • 根据违法经营额的大小，处以不同额度的罚款。违法经营额1万元以上的，并处违法经营额5倍以上10倍以下的罚款；违法经营额不足1万元的，可处以5万元以下的罚款。

2. 停业整顿与吊销许可证：

   • 若情节严重，如多次违法、造成恶劣社会影响等，除了没收与罚款外，还可能被责令限期停业整顿。
   • 在极端情况下，原发证机关可能吊销其出版许可证，禁止其继续从事出版活动。

三、刑事处罚措施

若出版非法出版物的行为构成犯罪，则将面临严厉的刑事处罚。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，可能涉及的罪名包括但不限于：

1. 非法经营罪：

   • 违反国家规定，扰乱市场秩序且情节严重的，将被判处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金。
   • 情节特别严重的，将被判处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产。

2. 其他相关罪名：

   • 如出版物含有煽动分裂国家、颠覆国家政权、侮辱、诽谤或传播淫秽物品等禁止内容，将依照刑法相关规定定罪处罚。
   • 例如，以牟利为目的出版淫秽物品的，可能构成传播淫秽物品牟利罪，面临更严厉的刑罚。

四、综合考量与建议

在司法实践中，对出版非法出版物行为的认定和处罚会综合考虑多种因素，包括出版物的性质、数量、违法经营额以及社会危害后果等。因此，我建议您：

• 严格遵守法律法规：确保所有出版活动均经过正规渠道审批，并符合国家法律法规的要求。
• 加强内部管理：建立健全的出版审核机制，防止非法出版物的产生和传播。
• 及时咨询与整改：如发现存在非法出版行为，应立即停止并咨询相关部门进行整改，以减轻或避免法律责任。

总之，出版非法出版物是一项严重的违法行为，不仅可能面临经济上的巨大损失，还可能损害企业的声誉和经营资格，甚至承担刑事责任。因此，我强烈建议您严格遵守相关法律法规，确保出版的合法性。