不可以擅自摘抄涉密文件中的非涉密内容。这一结论主要基于以下几点法律和管理规定：

一、涉密文件的整体保密性

涉密文件，无论其内容是否全部涉密，都作为一个整体受到保密法的保护。这是因为涉密文件的性质、来源和用途都决定了其需要严格的保密管理。即使文件中的某些部分看似非涉密，也可能与涉密内容存在关联，或者单独看虽无涉密信息，但结合其他信息可能构成涉密。因此，不能简单地根据内容是否涉密来决定是否可以摘抄。

二、保密法的相关规定

根据保密法及其实施条例，对涉密文件的管理有严格的规定。特别是关于复制、复印、摘抄、汇编涉密载体的规定，明确指出：

• 绝密级文件：非经原确定密级的机关单位或者上级机关批准，不得复制和摘抄。
• 机密级和秘密级文件：复制、复印、摘抄、汇编必须经过批准并履行审批手续。这包括复印、复制本机关本单位产生的密件，应当经本机关本单位主管领导批准；复印、复制上级机关下发或其他机关单位制发的密件，应当经制发机关批准。

这些规定表明，无论涉密文件中的内容是否涉密，摘抄行为都需要经过严格的审批程序。

三、保密管理的实际需要

从保密管理的实际需要来看，对涉密文件的任何处理，包括摘抄，都需要谨慎对待。因为涉密文件的泄露可能对国家安全、利益造成严重损害。因此，即使摘抄的是非涉密内容，也可能因为处理不当而导致涉密信息的泄露。例如，摘抄过程中可能无意中包含了与涉密内容相关的信息，或者摘抄后的文件管理不善导致泄露。

四、法律后果

如果未经批准擅自摘抄涉密文件中的内容，无论是否涉密，都可能构成违法行为。根据保密法的相关规定，违反保密规定的行为可能会受到行政处罚，甚至可能构成犯罪，依法追究刑事责任。

建议

1. 严格遵守保密规定：在处理涉密文件时，务必严格遵守保密法的相关规定，不得擅自摘抄、复制、复印或汇编涉密文件。
2. 履行审批手续：如果因工作需要确实需要摘抄涉密文件中的内容，应当按照规定履行审批手续，获得批准后方可进行。
3. 加强保密意识：提高保密意识，认识到涉密文件的重要性和敏感性，避免因疏忽大意而导致泄密事件的发生。

如果您在处理涉密文件时遇到任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。