在交通事故中，如果电瓶车车主不愿意来交警队定责，这确实是一个比较棘手的问题，但您可以通过以下步骤来妥善应对，以确保自身权益得到维护：

一、立即报警并保护现场

首先，您应立即报警，并等待交警的到来。在等待期间，务必尽力保护事故现场，防止现场被破坏或证据遗失。这有助于交警后续进行事故认定和责任划分。

二、与交警详细沟通并协助调查

当交警到达现场后，您应详细向他们说明事故经过，包括电瓶车车主受伤的情况以及他们不愿意配合处理的态度。交警会根据现场勘查、调查取证等，依法出具《交通事故认定书》，这是后续处理事故和索赔的重要依据。

三、尝试与电瓶车车主沟通协商

在交警处理事故的同时，您可以尝试主动与电瓶车车主联系，解释处理事故的必要性和重要性，尝试协商一个双方都能接受的处理方案。如果对方因特殊原因无法立即前来交警队，您可以协商一个双方方便的时间共同前往。

四、申请交警组织调解

如果双方无法直接协商达成一致，您可以根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，向交警申请组织调解。交警会依法进行调解，以期双方能够达成赔偿协议。

五、保留并收集相关证据

在整个处理过程中，您应保留好事故现场的照片、视频、证人证言等证据，以证明事故情况和责任划分。同时，如果电瓶车车主受伤，您还应收集医疗记录、费用清单等与对方受伤相关的证据，为后续赔偿提供依据。

六、通过法律途径解决

如果调解无果或电瓶车车主仍然拒绝配合处理，您可以考虑向法院提起民事诉讼，要求对方承担相应赔偿责任。在诉讼过程中，法院会根据法律规定和事实情况进行判决，确保您的合法权益得到维护。

七、关注对方伤情并提供必要帮助

尽管电瓶车车主不愿意配合处理，但您仍应关注其伤情，并在能力范围内提供必要的帮助。如果对方需要紧急救治，您应协助联系医疗机构并垫付必要的医疗费用（垫付后可在后续赔偿中主张返还）。

八、了解自身法律责任

作为事故的一方，您需要了解自己应承担的法律责任。如果事故责任在您，您需要承担对方因事故造成的全部损失，包括医疗费、误工费、护理费、交通费等。如果行为构成交通肇事逃逸或其他犯罪行为，还可能面临刑事处罚。因此，务必积极配合处理并履行法律责任。

综上所述，面对电瓶车车主不愿意来交警队定责的情况，您应通过法律途径来维护自己的权益。在整个处理过程中，保持冷静和理性，积极配合交警和法院的工作，并妥善保留好相关证据。