在高速三车道上，小车在快车道以90码行驶是否会被扣分罚款，需分情况讨论：

1. 若该高速公路限速低于90km/h
   根据《道路交通安全法》及实施条例，超速行驶的处罚标准如下：

   • 超过限速10%以上未达20%的，处警告或20-200元罚款，记3分；
     
   • 若限速为80km/h，90码已超速12.5%，属于上述情形，可能被处罚。
     关键点：需以具体路段限速标志为准，部分路段可能因施工、天气等临时调整限速。

2. 若该高速公路限速等于或高于90km/h

   • 若限速为90km/h，90码属于正常行驶，不构成违法；
     
   • 若限速为100km/h或更高，90码虽未超速，但需注意：
     
     • 快车道（超车道）通常建议保持较高车速，长期低速行驶可能因“不按规定车道行驶”被处罚（如未保持车速影响后方车辆通行）；
       
     • 部分地区规定，快车道最低限速不得低于某数值（如80km/h），若90码低于该标准，仍可能被处罚。

3. 特殊情形补充

   • 分道限速：部分高速公路对不同车道设置不同限速（如快车道限速120km/h，慢车道限速100km/h），需以车道限速标志为准；
     
   • 地区差异：各地对超速、低速行驶的处罚标准可能略有不同，需结合具体省份的《道路交通安全条例》判断。

建议：

• 行驶前通过导航软件或路标确认路段限速；
  
• 快车道行驶时，尽量保持与车流速度一致，避免长期“龟速”行驶影响安全；
  
• 若收到罚单，可核对违法代码（如超速为1352、不按规定车道行驶为6023等），确认处罚依据是否准确。
  

如有进一步疑问，可直接向我咨询具体路段或地区规定。