公司克扣员工绩效工资是否违法，需根据具体情况判断。以下从合法与违法两种情形进行详细分析，并提供相应的法律建议：
一、合法扣减绩效工资的情况
劳动者未达到绩效标准：
- 若公司的绩效考核制度内容明确具体，如考核指标、评分标准等清晰界定，且制定程序合法，并已向员工公示或告知。员工因自身工作原因确实未达到相应绩效要求，公司按照制度扣减绩效工资，通常是合法的。例如，某公司规定销售岗位员工每月需完成10万元销售额，若员工未完成，则按未完成比例扣减绩效工资，这种扣减是合法的。
劳动者给单位造成损失：
- 当员工因故意或重大过失给用人单位造成经济损失时，公司可依据劳动合同约定要求其赔偿。赔偿可从员工工资中扣除，但每月扣除部分不得超过员工当月工资的20%，且扣除后剩余工资不得低于当地月最低工资标准。例如，员工因操作失误导致公司设备损坏，需赔偿维修费用，公司可从其工资中合理扣减。
二、违法扣减绩效工资的情况
无正当理由随意扣减：
- 公司未建立合理的绩效考核制度，或未按制度执行，而是无故扣减员工绩效工资，属于违法行为。例如，公司未制定明确的考核标准，却以“表现不佳”为由随意扣减员工绩效工资，这种行为违法。
以绩效之名恶意扣减：
- 公司可能借绩效考核之名，实际上为惩罚员工、强迫离职或其他恶意目的而扣减绩效工资，此行为违法。例如，公司为逼迫某员工离职，故意设定不可能完成的绩效目标，并以此为由扣减其绩效工资，这种行为构成违法。
制度存在重大漏洞或显失公平：
- 绩效考核制度本身存在重大问题，导致员工绩效工资被不合理扣减，违反劳动法规定。例如，公司制定的考核制度中，某些指标设定不合理，导致大部分员工都无法达到，从而被扣减绩效工资，这种制度显失公平，扣减行为违法。
扣除比例过高：
- 即使绩效考核制度合法，但若扣除的绩效工资数额超出法律规定范围（如超过员工当月工资的20%），也构成违法扣除。例如，员工当月工资为5000元，公司却扣减了3000元绩效工资，这种扣减比例过高，违法。
三、法律建议与维权途径
确认克扣行为合法性：
- 员工应首先查阅劳动合同和绩效考核制度，确认公司扣减绩效工资是否有合法依据。若合同或制度中未明确约定，或公司未按约定执行，则克减行为可能违法。
与公司沟通协商：
- 员工可与公司上级领导或人力资源部门进行友好沟通，表达对绩效工资克扣的疑问，并要求对方说明克扣的原因和依据。若沟通无果，可提交书面申诉，详细陈述事实理由，并附上相关证据材料。
收集与保留证据：
- 员工应收集并保留与绩效工资相关的证据，如劳动合同、工资条、绩效评估文件、工作成果记录、考核申诉书、公司回复函、与绩效相关的沟通邮件或聊天记录等。这些证据在后续维权过程中将起到关键作用。
向劳动监察部门投诉：
- 若公司拒绝支付被克扣的绩效工资，员工可向当地劳动监察部门提交投诉申请，详细说明公司克扣绩效工资的情况，并提交相关证据。劳动监察部门将依法进行调查处理。
申请劳动仲裁或提起诉讼：
- 若劳动监察部门的处理未能达到预期效果，员工可向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁。仲裁申请应在规定的时效内提出（一般为知道或应当知道权利被侵害之日起一年内）。若对仲裁裁决不服，员工还可在规定时间内向人民法院提起诉讼。
总之，公司克扣员工绩效工资是否违法，需根据具体情况判断。员工在遇到此类问题时，应依法依规行事，通过确认克扣行为的合法性、与公司沟通协商、收集与保留证据、向劳动监察部门投诉以及申请劳动仲裁或提起诉讼等途径来维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。