合作借款与合作投入的基础法律关系并不必然都是合作关系，具体需根据实际情况和法律关系的实质来判断。以下从不同角度进行分析：

一、合作借款的法律关系

合作借款，通常指的是两个或两个以上的主体共同向第三方借款，或者一方借款后，另一方以某种形式参与借款的使用或还款。这种行为的法律关系可能涉及：

1. 共同借款关系：如果各方共同作为借款人向出借人借款，并共同承担还款责任，那么这种法律关系就是共同借款关系。在此情况下，各方之间可能形成合作关系，共同对借款的使用和还款负责。但严格来说，共同借款关系本身并不等同于合作关系，它只是合作关系在借款领域的一种表现形式。
2. 借贷关系与合作关系并存：有时，合作借款可能涉及更复杂的法律关系。例如，一方借款后，另一方以提供担保、共同使用借款资金或参与还款等方式参与其中。这种情况下，除了借贷关系外，还可能存在担保关系、合作关系等其他法律关系。

二、合作投入的法律关系

合作投入，指的是两个或两个以上的主体为了共同的目的或项目，各自投入资金、技术、设备等资源。这种行为的法律关系可能涉及：

1. 合伙关系：如果各方投入资源是为了共同经营一个项目或企业，并共享收益、共担风险，那么这种法律关系就是合伙关系。合伙关系是一种典型的合作关系，各方在合伙协议的基础上，共同对合伙事务进行管理和决策。
2. 合作合同关系：有时，合作投入可能并不形成合伙关系，而是基于一份合作合同。合作合同是各方为了共同实现某一目标而订立的协议，它规定了各方的权利、义务和责任。在合作合同关系中，各方虽然共同投入资源，但并不一定共享收益或共担风险，而是根据合同的约定来分配利益和承担责任。
3. 其他法律关系：合作投入还可能涉及其他法律关系，如投资关系、借贷关系等。这取决于各方投入资源的目的、方式以及合同的具体约定。

三、法律关系的判断依据

在判断合作借款或合作投入的基础法律关系时，应重点关注以下几点：

1. 合同约定：各方之间的合同是判断法律关系的重要依据。合同中应明确各方的权利、义务和责任，以及合作的目的、方式和期限等。
2. 实际行为：除了合同约定外，各方的实际行为也是判断法律关系的重要依据。例如，各方是否共同参与借款的使用或还款、是否共同经营项目或企业等。
3. 法律特征：不同的法律关系具有不同的法律特征。例如，合伙关系具有共享收益、共担风险的特征；借贷关系则具有借款人到期还款、出借人收取利息的特征。

建议：在实际操作中，如果涉及合作借款或合作投入，建议各方在订立合同前明确各自的权利、义务和责任，并咨询专业律师的意见，以确保合同的合法性和有效性。如果你有具体的法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。