结论：个体户与公司之间进行业务往来时，可以签订协议而不一定非要签订格式化的合同，但协议内容必须符合法律规定，且双方意思表示真实，否则可能不具备法律约束力。以下是对此问题的详细分析：

一、法律主体资格与协议效力

在我国法律体系中，个体户和企业均被认定为合法的经营主体，具备签订协议或合同的法律资格。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，个体工商户作为自然人从事工商业经营并经依法登记的经济组织形式，享有相对独立的法律主体地位，能够以自己的名义从事经营活动并签订协议。企业作为依法设立的经济组织，同样具备签订协议的主体资格。因此，个体户与企业在法律地位上是平等的，可以基于双方真实的意思表示进行商业合作并签订协议。

二、协议与合同的区别及协议的法律要求

1. 协议与合同的区别：

   • 协议通常更为灵活，可以涵盖各种形式的合作安排，不一定需要遵循严格的合同格式。
   • 合同则通常具有更明确的条款和结构，包括标的、数量、质量、价款或报酬、履行期限、地点和方式、违约责任等关键条款。

2. 协议的法律要求：

   • 无论协议的形式如何，其内容必须符合法律规定，不得违反法律、行政法规的强制性规定，不得违背社会公共利益和公序良俗。
   • 协议双方的意思表示必须真实，不存在欺诈、胁迫等情形。
   • 如果协议中包含需要办理批准手续等特定条件，双方必须按照约定履行相关手续，否则可能会影响协议的效力及双方的权利义务。

三、协议签订与履行的建议

1. 明确协议内容：

   • 尽管协议可以更为灵活，但建议双方在签订协议时尽可能明确合作的具体内容、权利义务、履行方式、违约责任等关键条款，以减少后续纠纷的可能性。

2. 遵循法律程序：

   • 如果协议涉及需要办理批准手续或登记等特定程序，双方应按照法律规定及时办理，以确保协议的合法性和有效性。

3. 保留书面证据：

   • 无论协议是口头还是书面形式，建议双方都保留好相关证据，如聊天记录、邮件往来、签字确认的协议文本等，以便在发生纠纷时能够证明双方的真实意思表示和合作情况。

四、实例分析

在商业实践中，个体户与企业签订协议的案例屡见不鲜。例如，个体经营的广告设计工作室可能与某公司签订广告设计服务协议，明确设计要求、费用支付、交付时间等关键条款。这样的协议不仅促进了商业活动的顺利进行，也维护了市场秩序和双方的合法权益。

五、法律后果

如果个体户与企业签订的协议内容合法、意思表示真实，且双方按照协议约定履行了各自的义务，那么该协议将具有法律约束力。如果一方违反协议约定，另一方有权依据协议约定和法律规定要求违约方承担违约责任。

总结与建议：个体户与公司之间进行业务往来时，可以签订协议而不一定非要签订格式化的合同。但无论选择哪种形式，都必须确保协议内容合法、意思表示真实，并尽可能明确合作的具体内容和权利义务。如果对协议签订或履行过程中有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。