结论：工程交付后业主方已经装修了提出处罚是否合法，这取决于多个因素，包括合同条款、工程是否存在质量问题、处罚的依据以及处罚的程序等。以下从不同角度进行分析：

1. 合同条款的约定：

   • 合法性分析：首先，需要审查工程合同中是否有关于工程交付后业主方提出处罚的相关条款。如果合同中明确规定了业主方在工程交付后一定期限内，因工程存在质量问题或其他违约行为可以提出处罚，并且该条款不违反法律法规的强制性规定，那么业主方的处罚行为在合同层面可能是合法的。
   • 建议：建议仔细审查合同条款，特别是关于质量保修、违约责任和处罚措施等方面的规定，以确定业主方的处罚是否有合同依据。

2. 工程是否存在质量问题：

   • 合法性分析：如果工程确实存在质量问题，且这些问题影响了工程的使用功能或安全性，那么业主方在工程交付后提出处罚可能是合理的。然而，处罚的合法性还取决于处罚的依据是否充分，以及处罚的程序是否合法。
   • 建议：如果业主方提出处罚，应要求其提供充分的证据证明工程存在质量问题，并明确处罚的具体依据和程序。同时，也可以考虑委托第三方机构对工程质量进行鉴定。

3. 处罚的依据和程序：

   • 合法性分析：处罚的依据必须合法，不能违反法律法规的强制性规定。同时，处罚的程序也必须合法，包括处罚的通知、听证、决定等环节。如果业主方在处罚过程中违反了法定程序，那么处罚行为可能是违法的。
   • 建议：如果业主方提出处罚，应要求其明确处罚的依据和程序，并确保这些依据和程序符合法律法规的规定。如果认为处罚行为违法，可以依法提出异议或申请行政复议、提起行政诉讼等。

4. 装修行为对处罚的影响：

   • 合法性分析：业主方在工程交付后进行装修，并不一定影响其提出处罚的合法性。然而，如果装修行为改变了工程的原状，使得原本存在的问题变得难以判断或无法证明，那么这可能会对处罚的合法性产生影响。
   • 建议：如果业主方在装修后提出处罚，应要求其提供装修前工程存在问题的证据，并考虑装修行为对证据的影响。同时，也可以考虑委托第三方机构对装修前后的工程状况进行鉴定。

进一步思考：在处理此类纠纷时，建议双方首先通过协商解决争议。如果协商不成，可以考虑通过调解、仲裁或诉讼等法律途径解决。在处理过程中，应注重收集证据，包括合同、工程验收报告、质量鉴定报告等，以支持自己的主张。

最后，如果你在处理此类纠纷时遇到任何法律问题或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。我专注于合同纠纷领域，能够为你提供专业的法律帮助。