辞退员工的赔偿金是按照应发工资来计算，而非实发工资。以下是对此问题的详细分析：
一、法律依据
《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条：
- 经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
- 本条所称月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。
《中华人民共和国劳动合同法实施条例》第二十七条：
- 劳动合同法第四十七条规定的经济补偿的月工资按照劳动者应得工资计算，包括计时工资或者计件工资以及奖金、津贴和补贴等货币性收入。
二、应发工资与实发工资的区别
应发工资：
- 指用人单位依据国家有关规定或劳动合同的约定，以货币形式直接支付给本单位劳动者的劳动报酬。
- 一般包括计时工资、计件工资、奖金、津贴和补贴、延长工作时间的工资报酬以及特殊情况下支付的工资等。
- 是任何税费和其他扣款之前的总额，能更全面、真实地反映劳动者的收入状况。
实发工资：
- 即劳动者实际收到的工资，是应发工资扣除个人所得税、社会保险费个人缴纳部分、住房公积金个人缴纳部分以及其他可能的扣款（如迟到罚款等）后的净额。
- 由于扣除了多项费用，不能准确体现劳动者的完整收入情况。
三、为何采用应发工资计算赔偿金
法律规定：
- 如前所述，相关法律法规明确规定经济补偿金应按照应发工资计算。
全面反映劳动报酬：
- 应发工资包含了所有货币性收入，如基本工资、奖金、津贴等，能更准确地体现劳动者的实际劳动报酬水平。
- 实发工资则因扣除了各种税费和个人缴纳部分，可能无法准确体现劳动者的真实收入水平。
四、具体计算示例
假设员工小李每月基本工资6000元，加上奖金800元和各项补贴500元，那么他的应发工资为7300元。若当月扣除个人所得税200元、社保个人缴纳部分400元、住房公积金个人缴纳部分600元，其实发工资为5900元。在辞退计算经济补偿时，应以7300元（应发工资）为准，而非5900元（实发工资）。
五、特殊情况说明
- 如果劳动者在劳动合同解除或者终止前12个月的平均工资低于当地最低工资标准的，按照当地最低工资标准计算。
- 如果劳动者工作不满12个月的，按照实际工作的月数计算平均工资。
综上所述，辞退员工的赔偿金是按照应发工资来计算的，这一规定既符合法律法规，也能更全面地保障劳动者的权益。如果您在劳动工伤（工资福利）方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。