事业单位旷工的扣钱方式需依据单位规章制度及法律法规综合确定，具体如下：

1. 单位规章制度优先适用
   根据《事业单位人事管理条例》第十五条，事业单位可依法制定内部规章制度，明确旷工的处罚标准。若单位已通过民主程序（如职工代表大会）制定并公示了《考勤管理办法》，且内容不违反法律强制性规定（如最低工资标准、劳动保护等），则优先按制度执行。例如：

   • 旷工1天扣当日工资；
     
   • 旷工3天以上扣发当月绩效奖金；
     
   • 连续旷工超15日或累计超30日，单位可解除聘用合同。
     （注：单位需确保制度内容合法、程序合规，否则可能面临劳动争议败诉风险。）

2. 无明确制度时的法律底线
   若单位未制定规章制度或制度无效，则需遵循以下原则：

   • 工资支付义务：根据《工资支付暂行规定》，用人单位不得克扣劳动者工资，但因劳动者本人原因造成单位经济损失的，可按劳动合同约定要求赔偿。旷工本身不直接等同于“造成经济损失”，单位需举证实际损失（如因缺岗导致的额外用工成本）才能扣款。
     
   • 最低工资保障：即使扣款，劳动者当月实得工资也不得低于当地最低工资标准。例如，若当地最低工资为2000元/月，劳动者旷工1天扣500元后，剩余工资仍需≥2000元。

3. 特殊情形下的处理

   • 医疗期旷工：若劳动者处于医疗期内（因病或非因工负伤），单位原则上不得以旷工为由扣款或解除合同，否则可能构成违法解除。
     
   • 工会程序要求：根据《劳动合同法》第四十三条，单位单方解除劳动合同（如因旷工严重违纪）需事先通知工会；未建立工会的，需向上级工会征求意见。未履行该程序可能被认定为违法解除。

建议：

• 对劳动者：若单位扣款不合理，可要求单位出示规章制度依据，并核对是否经过民主程序公示；若扣款后工资低于最低标准，可向劳动监察部门投诉。
  
• 对单位：制定规章制度时需明确旷工定义（如未按规定请假且未到岗）、扣款标准（如按日工资比例）及解除合同条件，并通过职工代表大会或全体职工讨论、公示，确保程序合法。
  

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