结论概述：同方股份与西物院签署的合作协议，从新闻背景描述及一般法定程序要求来看，大概率遵循了相关法定程序。以下结合新闻背景及法定程序要求进行详细分析。
一、合作协议签署的法定程序概述
在签署合作协议时，通常需遵循以下法定程序：
- 主体资格审查：确保双方具备签署协议的主体资格，即双方均为依法设立并有效存续的法人或其他组织，具备签署协议的民事权利能力和行为能力。
- 意思表示真实：协议内容应体现双方真实的意思表示，不存在欺诈、胁迫等情形。
- 内容合法合规：协议内容应符合法律法规的强制性规定，不违反公序良俗。
- 签署形式合法：根据协议性质及法律规定，可能需要采用书面形式，并由双方签字或盖章确认。
二、结合新闻背景分析
主体资格：
- 同方股份（600100）作为上市公司，其主体资格无疑符合法定要求。
- 西物院作为核工业西南物理研究院，同样具备签署合作协议的主体资格。
意思表示真实：
- 新闻背景中提到，双方是在前期保持密切交流的基础上，实质性推进合作，并共同见证了战略合作协议的签署。这表明双方对合作内容有充分了解，且意思表示真实。
内容合法合规：
- 协议内容聚焦数智技术与聚变技术的创新融合，涉及关键产品、设备研发及成果转化、数据治理和大模型赋能等领域，这些内容均符合国家鼓励和支持的科技创新方向，且未违反任何法律法规的强制性规定。
- 特别是考虑到2026年1月即将施行的《中华人民共和国原子能法》明确鼓励与支持受控热核聚变研发，双方的合作内容更是与国家政策导向高度契合。
签署形式合法：
- 新闻背景中明确提到，双方代表共同见证了战略合作协议的签署，且由西物院副院长与公司党委委员、副总裁代表双方签约。这表明协议采用了书面形式，并由双方授权代表签字确认，符合签署形式的法定要求。
三、可能涉及的特别法定程序
若合作协议涉及特定领域或特定类型的交易（如涉及国有资产转让、外资并购等），可能还需遵循额外的法定程序，如审批、备案等。但从新闻背景来看，双方的合作主要聚焦于数智技术与聚变技术的创新融合，并未提及涉及此类特殊交易，因此无需额外考虑特别法定程序。
四、对公众的启示
- 关注主体资格：在签署合作协议时，应首先确认双方是否具备签署协议的主体资格，以避免因主体不适格而导致的协议无效风险。
- 确保意思表示真实：双方应充分沟通、协商，确保协议内容体现双方真实的意思表示，避免因信息不对称或误解而引发的纠纷。
- 审查内容合法性：协议内容应符合法律法规的强制性规定，不违反公序良俗，以确保协议的合法性和有效性。
- 遵循签署形式要求：根据协议性质及法律规定，选择合适的签署形式（如书面形式），并由双方授权代表签字或盖章确认，以确保协议的签署程序合法合规。
综上所述，同方股份与西物院签署的合作协议，从新闻背景描述及一般法定程序要求来看，大概率遵循了相关法定程序。若您在合作过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。