关于职务犯罪认定自首存在的问题，我们可以从以下几个方面进行深入探讨：
一、自首的认定条件
根据刑法及相关司法解释，自首需同时具备自动投案和如实供述自己的罪行两个要件。在职务犯罪案件中，这一认定标准同样适用。然而，在实际操作中，对于“自动投案”和“如实供述自己的罪行”的理解与把握，往往存在一些争议和难点。
自动投案：自动投案的本质是被调查人犯罪后，在人身自由的状态下，自愿、主动将自己置于办案部门的控制之下。这意味着，如果犯罪分子是在被办案机关掌握线索、受到调查谈话、讯问或采取强制措施之前主动投案的，才能认定为自动投案。如果犯罪分子是在被采取强制措施后才交代问题的，则不能认定为自首。
如实供述自己的罪行：犯罪分子必须如实交代自己的主要犯罪事实，包括犯罪的时间、地点、手段、结果等。如果犯罪分子只交代了部分犯罪事实，或者隐瞒了重要情节，或者故意歪曲事实，都不能认定为如实供述自己的罪行。
二、职务犯罪自首认定的特殊问题
线索掌握情况：在职务犯罪案件中，办案机关往往已经掌握了一定的线索或证据。这时，犯罪分子是否构成自首，关键在于其投案的时间和交代的罪行内容。如果犯罪分子在办案机关掌握其罪行之前主动投案，并如实交代了自己的罪行，那么即使办案机关已经掌握了一定的线索，也可以认定为自首。但如果犯罪分子是在办案机关已经掌握其罪行之后才投案的，或者虽然投案但未能如实交代自己的罪行，那么就不能认定为自首。
投案动机和目的：在职务犯罪案件中，犯罪分子的投案动机和目的也是影响自首认定的重要因素。如果犯罪分子是出于真诚悔罪、争取从宽处理等正当目的而投案的，那么可以认定为自首。但如果犯罪分子是出于逃避法律制裁、掩盖罪行等不正当目的而投案的，那么就不能认定为自首。
单位犯罪的自首：在单位犯罪案件中，单位自首的认定也有其特殊性。如果单位集体决定或者单位负责人决定而自动投案，如实交代单位犯罪事实的，应当认定为单位自首。但如果单位直接负责的主管人员或者直接责任人员自动投案并如实交代自己知道的犯罪事实的，对该直接责任人员应当认定为自首。如果单位没有自首，而直接责任人员自动投案并如实交代自己知道的犯罪事实的，对该直接责任人员也可以认定为自首。
三、职务犯罪自首认定的实践难点
证据收集与审查：在职务犯罪案件中，证据的收集与审查往往较为复杂。办案机关需要仔细甄别犯罪分子的供述与其他证据之间的关联性和一致性，以确保自首认定的准确性。
政策把握与裁量：自首作为一种量刑情节，其认定和处理需要充分考虑犯罪的事实、性质、情节和对于社会的危害程度等因素。办案机关在裁量时需要准确把握政策界限和裁量标准，以确保自首认定的公正性和合理性。
综上所述，职务犯罪认定自首存在的问题主要涉及自首的认定条件、特殊问题以及实践难点等方面。在实际操作中，需要办案机关根据具体情况进行仔细甄别和裁量，以确保自首认定的准确性和公正性。如果您在职务犯罪自首认定方面遇到任何问题或疑问，欢迎随时向我咨询。