结论：执业医师变更时若缺少短期工作经历且已超2年，需根据具体情况判断是否影响变更流程，并采取相应措施。以下从多个角度进行分析：
一、执业医师变更的基本要求与流程
执业医师变更执业地点、执业类别、执业范围等注册事项时，通常需要向拟执业机构所在地的卫生行政部门提出申请，并提交相关材料，如《医师变更执业注册申请审核表》、医师资格证书、医师执业证书等。短期工作经历并非所有变更情况下的必备条件，它可能因地区、变更类型（如跨省变更、跨类别变更等）及当地卫生行政部门的具体要求而有所不同。
二、缺少短期工作经历且已超2年的情况分析
若变更不涉及工作经历要求：
- 如果变更类型不涉及对工作经历的特定要求（如仅变更执业地点而不改变执业类别或范围），则缺少短期工作经历通常不会成为阻碍。此时，您只需按照正常流程提交变更申请及相关材料即可。
若变更涉及工作经历要求：
- 若当地政策允许补交或说明情况：部分地区可能允许申请人在变更时补交相关的工作经历证明或提供情况说明，以解释缺少短期工作经历的原因。此时，您应积极与当地卫生行政部门沟通，了解具体政策，并准备相应的材料。
- 若当地政策严格且无法补交：如果当地政策对工作经历有严格要求，且无法补交或说明情况，则可能面临变更受阻的风险。此时，您可能需要考虑先积累一定的工作经历，或寻找其他符合变更条件的途径（如通过进修、培训等方式提升专业能力，以满足变更要求）。
三、建议与措施
了解当地政策：
- 在申请变更前，务必详细了解拟执业机构所在地的卫生行政部门对执业医师变更的具体要求，特别是关于工作经历的规定。
准备充分材料：
- 根据当地政策要求，准备齐全、真实的变更申请材料。如果缺少短期工作经历，但其他条件均符合，可尝试提供情况说明或其他相关证明材料，以增加变更成功的可能性。
积极沟通与协商：
- 在申请过程中，积极与当地卫生行政部门沟通，了解审批进度和可能遇到的问题。如果因缺少短期工作经历而面临困难，可尝试协商解决方案，如补交材料、提供情况说明或参加相关培训等。
寻求法律援助：
- 如果认为自己的权益受到侵害或变更申请受到不公正对待，可寻求法律援助或咨询专业律师（如我），以维护自己的合法权益。
最后，执业医师变更是一个涉及多个环节和因素的过程，缺少短期工作经历且已超2年并不一定意味着无法变更。关键在于了解当地政策、准备充分材料、积极沟通与协商，并在必要时寻求法律援助。如果您有任何疑问或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。