二次抵押他项权证金额的认定，主要依据抵押合同约定、抵押物剩余价值以及相关法律规定来确定。以下从不同角度详细说明：

1. 依据抵押合同约定
   二次抵押的他项权证金额，首先以抵押人与抵押权人签订的抵押合同中约定的金额为准。合同中应明确记载二次抵押的债权数额、担保范围等核心条款。若合同约定清晰且不违反法律强制性规定，则直接以合同约定金额办理他项权证登记。
   例如：抵押物评估价值为500万元，首次抵押债权为300万元，抵押人与第二抵押权人约定二次抵押债权为150万元，则他项权证金额可登记为150万元。

2. 基于抵押物剩余价值
   二次抵押的金额不得超过抵押物剩余价值（即抵押物评估价值减去首次抵押债权金额后的余额）。若合同约定金额超过剩余价值，超出部分可能因无法优先受偿而被认定为无效。
   法律依据：根据《民法典》第414条，同一财产向两个以上债权人抵押的，拍卖、变卖抵押财产所得的价款，按照登记的先后顺序清偿；顺序相同的，按照债权比例分配。因此，二次抵押金额需以剩余价值为限，否则可能影响第二抵押权人的权益。
   例如：抵押物评估价值500万元，首次抵押债权300万元，剩余价值200万元。若二次抵押合同约定金额为250万元，则他项权证仅能对200万元部分有效登记，超出部分无法优先受偿。

3. 结合登记部门审核要求
   不动产登记部门在办理二次抵押他项权证时，会审核抵押物剩余价值是否覆盖二次抵押金额。若登记部门认为合同约定金额不合理（如超过剩余价值），可能要求调整金额或拒绝登记。
   实务提示：建议抵押人与抵押权人在签订合同前，共同委托专业评估机构对抵押物价值进行评估，并明确约定“以登记部门最终审核金额为准”，以避免后续纠纷。

4. 特殊情形下的金额认定

   • 顺位变更协议：若首次抵押权人与抵押人、第二抵押权人签订顺位变更协议，明确二次抵押债权优先于首次抵押部分债权受偿的，他项权证金额可按协议约定调整，但需以抵押物总价值为限。
     
   • 最高额抵押：若二次抵押为最高额抵押，他项权证可登记最高债权额，但实际发生债权时仍需以抵押物剩余价值为限。

总结：二次抵押他项权证金额的认定需兼顾合同约定、抵押物剩余价值及登记部门审核要求。建议抵押人与抵押权人在签订合同前充分评估抵押物价值，并在合同中明确金额调整机制，以保障双方权益。如有具体案件或合同条款需要分析，可直接向我咨询。