股东死亡后，其配偶能否提起股东出资纠纷，需视具体情况而定。以下从不同角度进行分析：
一、股东资格继承与配偶权利
股东资格继承：根据《公司法》及相关司法解释，自然人股东死亡后，其合法继承人可以继承股东资格。这意味着，如果股东的配偶是其合法继承人之一，且其他继承人无异议或已达成继承协议，配偶有权继承股东资格，进而成为公司股东。
配偶作为继承人的权利：在继承股东资格后，配偶将享有与原股东相同的权利，包括参与公司决策、分红等。同时，如果原股东存在出资瑕疵或未履行出资义务，配偶作为新股东，理论上也需承担相应的责任。但这并不意味着配偶可以直接提起股东出资纠纷，除非其作为公司股东，且纠纷涉及公司利益或其自身权益。
二、股东出资纠纷的提起主体
公司作为提起主体：股东出资纠纷通常涉及公司利益，因此公司有权作为原告提起诉讼，要求未履行出资义务的股东承担责任。在这种情况下，配偶如果未继承股东资格，则不是适格的原告。
其他股东作为提起主体：如果股东未履行出资义务，损害了其他股东的利益，其他股东也有权提起诉讼。但同样，配偶如果未继承股东资格，则不具备提起此类诉讼的主体资格。
配偶作为股东提起诉讼：如果配偶继承了股东资格，且认为其他股东或公司存在出资瑕疵或未履行出资义务的情况，损害了其作为股东的权益，那么配偶有权作为原告提起股东出资纠纷诉讼。
三、特殊情况分析
配偶未继承股东资格：如果配偶未继承股东资格，而是由其他继承人继承，那么配偶通常无权直接提起股东出资纠纷。但配偶如果认为继承过程存在违法行为或损害了其合法权益，可以通过继承纠纷等途径寻求救济。
夫妻共同财产与股东出资：如果股东出资来源于夫妻共同财产，且配偶未继承股东资格，但认为股东出资部分应属于其个人财产或夫妻共同财产的一部分，那么配偶可能通过其他法律途径（如离婚财产分割、夫妻共同财产纠纷等）来维护自己的权益，而非直接提起股东出资纠纷。
四、法律建议
明确股东资格继承情况：在股东死亡后，首先应明确股东资格的继承情况，包括继承人范围、继承协议等。这有助于确定配偶是否具备提起股东出资纠纷的主体资格。
咨询专业律师：由于股东出资纠纷涉及复杂的法律关系和利益纠葛，建议配偶在考虑提起诉讼前咨询专业律师，以评估诉讼风险和可行性。
考虑其他救济途径：如果配偶不具备提起股东出资纠纷的主体资格或认为诉讼风险较大，可以考虑通过其他法律途径来维护自己的权益，如继承纠纷、夫妻共同财产纠纷等。
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