公积金贷款3年以上还款一般不收违约金，但具体是否收取需分情况讨论：

1. 正常提前还款情形
   根据《住房公积金管理条例》及各地公积金中心的操作规范，借款人正常还款满一定期限（通常为1年）后申请提前还款的，公积金中心不收取违约金。例如，北京市公积金中心规定，借款人正常还款满12个月后，可随时申请提前部分或全部还款，且无需支付额外费用。因此，若您已还款3年以上且属于正常提前还款，通常不会产生违约金。

2. 特殊合同约定情形
   若您与公积金中心或委托银行在贷款合同中明确约定了提前还款需支付违约金（如约定“还款未满5年提前还款需支付剩余本金1%的违约金”），则需按合同履行。此类条款多见于早期公积金贷款合同，近年已逐渐取消。建议您核查贷款合同中的“提前还款”条款，确认是否存在违约金约定。

3. 逾期还款后提前结清情形
   若您存在逾期还款记录，且在结清逾期款项后申请提前还款，部分公积金中心可能要求支付逾期罚息或违约金（但罚息与违约金性质不同）。此情形下，违约金是否收取需以合同约定及当地政策为准。

建议行动：

1. 查阅您的《住房公积金借款合同》中“提前还款”条款，确认是否有违约金约定；
   
2. 联系当地公积金管理中心或贷款银行，核实当前政策是否允许无违约金提前还款；
   
3. 若合同无约定且政策允许，可放心申请提前还款；若存在约定，需评估违约金成本后再决定。
   

如有其他细节需进一步分析，欢迎随时向我咨询。