当劳动者违反劳动合同中的保密条款时，这是一个涉及法律责任和用人单位权益保护的重要问题。以下是对此问题的详细解答：

一、明确违约事实与证据收集

首先，用人单位需要仔细审查劳动合同和保密协议的具体条款，明确保密义务的具体内容以及违约的具体情形。一旦发现劳动者有违反保密义务的行为，应立即着手收集相关证据，如泄露商业秘密的文件、邮件、聊天记录、文件传输记录等。这些证据在后续的法律程序中至关重要，是证明劳动者违约行为的关键。

二、尝试协商解决

在收集到足够证据后，用人单位可以尝试与违约劳动者进行内部沟通，了解其违约的原因和动机，并寻求和解的可能性。如果违约行为尚未造成严重后果，用人单位可以要求劳动者立即停止违约行为，并采取补救措施，如删除泄露的信息、签署保证书等。通过协商解决，可以节省时间和成本，同时维护双方的合作关系。

三、采取法律手段

如果协商无果，或者违约行为已经给用人单位造成了严重损失，那么用人单位需要采取法律手段来维护自身权益。

1. 向劳动仲裁机构申请仲裁：

   • 如果劳动合同中约定了仲裁条款，用人单位可以向当地的劳动仲裁机构申请仲裁。
   • 提交仲裁申请书时，需要详细说明违约事实、请求事项及理由，并提供相关证据。
   • 劳动仲裁机构将依法进行审理，并作出裁决。如果裁决有利于用人单位，而劳动者拒不履行，用人单位可以申请强制执行。

2. 向人民法院提起诉讼：

   • 如果劳动合同中没有约定仲裁条款，或者对仲裁结果不满意，用人单位可以直接向人民法院提起诉讼。
   • 在诉讼过程中，需要提交起诉状及相关证据，并按照法院的要求参加庭审。
   • 法院将根据事实和法律规定，作出判决。如果判决有利于用人单位，而劳动者拒不履行，用人单位同样可以申请强制执行。

3. 追究刑事责任（如适用）：

   • 如果劳动者的违约行为构成犯罪，如侵犯商业秘密罪，用人单位可以向公安机关报案，由公安机关立案侦查。
   • 经检察机关提起公诉后，由人民法院依法审判，追究劳动者的刑事责任。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，侵犯商业秘密罪可能面临有期徒刑和罚金的处罚。

四、法律后果与用人单位应对措施

劳动者违反保密义务，将可能面临支付违约金、赔偿损失、行政处罚乃至刑事处罚等法律后果。具体来说：

• 民事责任：劳动者需按合同约定支付违约金，并赔偿因违反保密义务给用人单位造成的直接经济损失和合理费用。若行为构成侵权，还需承担侵权赔偿责任。
• 行政责任：若涉及侵犯商业秘密且符合行政违法情形，劳动者将面临行政处罚，如罚款、责令停止违法行为等。
• 刑事责任：在严重情况下，劳动者可能构成侵犯商业秘密罪，面临有期徒刑和罚金的处罚。

因此，用人单位在发现劳动者违反保密义务后，应立即采取措施固定证据，并通过协商、劳动仲裁或诉讼等合法途径追究劳动者的法律责任。同时，用人单位也应加强保密管理，确保商业秘密的安全，防止类似事件再次发生。