结论：车贷5年，在还款3个月后想一次性还清，是否会有违约金，这主要取决于您与贷款机构签订的贷款合同中的具体条款。
分析说明：
合同条款的约定：
- 在大多数车贷合同中，贷款机构会明确约定提前还款的相关条款，包括是否允许提前还款、提前还款是否需要支付违约金以及违约金的计算方式等。
- 如果合同中明确规定了提前还款需要支付违约金，并且您在还款3个月后选择一次性还清，那么您就需要按照合同约定支付相应的违约金。
违约金的计算方式：
- 如果合同中规定了违约金，那么违约金的计算方式也会因合同而异。有的合同可能规定按照剩余本金的百分比来计算，有的则可能规定一个固定的金额。
- 计算公式示例（假设合同规定违约金为剩余本金的2%）：若剩余本金为X元，则违约金为\(X \times 2\%\)。但具体计算方式需以合同为准。
特殊情况：
- 也有一些车贷合同可能允许在一定条件下（如还款满一定期限后）提前还款而不需支付违约金。
- 另外，如果贷款机构在宣传或合同中未明确提及提前还款需要支付违约金，那么在您提前还款时，贷款机构通常无权要求您支付违约金。但这一点也需根据具体合同内容和相关法律法规来判断。
行动建议：
- 查阅合同：首先，建议您仔细查阅您与贷款机构签订的车贷合同，特别是关于提前还款和违约金的条款。
- 与贷款机构沟通：如果您对合同中的条款有任何疑问或不确定的地方，建议您直接与贷款机构进行沟通，以获取最准确的信息。
- 考虑经济成本：在决定是否提前还款时，除了考虑违约金的问题外，您还需要考虑提前还款可能带来的其他经济成本，如提前还款手续费等。
后续思考依据：
- 如果合同中确实规定了提前还款需要支付违约金，并且您决定提前还款，那么您需要按照合同约定支付违约金。否则，您可能会面临贷款机构的法律追索。
- 如果合同中未规定提前还款需要支付违约金或规定不明确，那么您可以与贷款机构协商解决。如果协商无果，您可以考虑寻求法律援助或咨询专业律师以维护自己的合法权益。
如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。