合同中同时出现“比例万分之一”和“万分之1”的表述，合同本身并不因此无效，但具体条款的效力及解释需根据合同整体内容、双方真实意思表示以及相关法律规定来确定。以下从不同角度进行分析：

1. 合同条款的表述与解释：

   • 在合同中，“比例万分之一”和“万分之1”在数学上是等价的，均表示0.0001的比例。因此，从数学角度看，这两种表述并不冲突。
   • 然而，在合同解释上，如果合同中同时出现这两种表述，且针对的是同一事项（如违约金比例、利息比例等），则可能引发解释上的争议。此时，应依据《中华人民共和国民法典》中关于合同解释的规定，结合合同的整体内容、双方的真实意思表示以及交易习惯等因素，来确定该条款的真实含义。

2. 合同效力的认定：

   • 合同的效力主要取决于其是否满足法律规定的生效要件，如当事人具有相应的民事行为能力、意思表示真实、不违反法律或行政法规的强制性规定等。
   • 合同中同时出现“比例万分之一”和“万分之1”的表述，并不直接构成合同无效的理由。除非这种表述导致了合同内容的歧义或不确定性，且双方无法达成一致解释，才可能影响合同的效力。但即便如此，也通常是通过合同解释或补充协议来解决，而非直接认定合同无效。

3. 实际操作建议：

   • 明确条款表述：在签订合同时，应尽量避免使用可能引发歧义的表述。对于比例等数值条款，应统一使用一种明确的表述方式（如“万分之一”或“0.0001”），以减少后续解释上的争议。
   • 补充协议或澄清：如果合同中已经出现了两种表述，且双方对此存在争议，可以通过签订补充协议或发出澄清函的方式，明确该条款的真实含义和双方的真实意思表示。
   • 寻求法律帮助：在无法自行解决争议时，可以寻求专业律师的帮助，通过法律途径解决争议。律师可以根据合同的具体内容、相关法律规定以及交易习惯等因素，为当事人提供专业的法律意见和解决方案。

总结来说，合同中同时出现“比例万分之一”和“万分之1”的表述，并不直接导致合同无效。但为了避免后续争议和误解，建议在签订合同时使用明确、统一的表述方式。如果已经出现了争议，可以通过补充协议、澄清函或法律途径来解决。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。