结论：交通事故发生3年后再申请车损评估，保险公司是否需要赔偿不能一概而论，需分情况讨论。
- 诉讼时效角度
根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。在交通事故车损赔偿纠纷中，诉讼时效一般从权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。如果事故发生后，您一直积极与保险公司沟通协商赔偿事宜，且没有超过诉讼时效，那么即使3年后申请车损评估，在评估结果能证明车损与该次事故存在因果关系的情况下，保险公司通常仍需承担赔偿责任。
但如果在事故发生后的3年期间内，您没有采取任何主张权利的行动，也没有诉讼时效中止、中断的法定事由，那么一旦超过诉讼时效，您向法院起诉要求保险公司赔偿时，保险公司可能会以超过诉讼时效为由进行抗辩，此时您可能会丧失胜诉权，保险公司也就无需进行赔偿。
- 保险合同约定角度
保险合同是投保人与保险公司之间约定权利义务关系的协议。不同的保险合同对于车损评估和赔偿的期限、条件等可能会有不同的约定。有些保险合同可能会规定，被保险人应在事故发生后的一定期限内（如几个月内）进行车损评估，并向保险公司提交相关报告和索赔申请，否则保险公司有权拒绝赔偿。如果您的保险合同中有此类明确约定，而您在3年后才申请车损评估，那么保险公司可能会依据合同条款拒绝赔偿。
不过，如果保险合同中没有对车损评估和赔偿的期限作出明确限制，或者该限制条款存在不合理、违反法律法规强制性规定等情况，那么该条款可能无效，您仍然有权要求保险公司根据实际车损情况进行赔偿。
- 车损因果关系角度
即使没有超过诉讼时效且保险合同没有明确限制，在3年后申请车损评估时，还需要证明车损与该次交通事故之间存在因果关系。如果经过评估，能够确定车辆目前的损失是由该次交通事故直接导致的，那么保险公司应当承担赔偿责任；但如果由于时间过长，车辆可能受到了其他因素的影响（如自然损耗、二次事故等），导致无法清晰区分车损与交通事故之间的因果关系，那么保险公司可能会对部分或全部损失拒绝赔偿。
建议：如果您遇到这种情况，建议您尽快收集与事故相关的证据（如事故认定书、现场照片、维修记录等），及时委托专业的车损评估机构进行评估，并向保险公司提出索赔申请。如果保险公司拒绝赔偿，您可以考虑通过法律途径解决纠纷。如果您还有其他疑问，欢迎随时向我咨询。