结论：合同清单中的建筑垃圾弃置费是否按土方弃置费计算，需依据合同具体条款来确定。若合同中有明确约定，则按约定执行；若无明确约定，则需根据实际情况和行业惯例进行判断，必要时可通过协商或法律途径解决。
详细分析：
合同有明确约定的情况：
- 如果合同中明确规定了建筑垃圾弃置费的计算方式，并且明确指出是按照土方弃置费来计算，那么双方应当按照合同约定执行。这种情况下，合同条款具有法律约束力，双方均需遵守。
合同无明确约定的情况：
- 行业惯例与实际情况：若合同中没有明确约定建筑垃圾弃置费的计算方式，那么需要参考行业惯例和实际情况。土方弃置费和建筑垃圾弃置费在性质上可能有所不同，土方弃置费通常指的是挖掘出的土壤或岩石的弃置费用，而建筑垃圾弃置费则可能包括各种建筑废弃物，如混凝土块、砖块、木材等。因此，两者在计算上可能存在差异。
- 协商与补充协议：在合同无明确约定的情况下，双方可以通过协商来达成一致，签订补充协议明确建筑垃圾弃置费的计算方式。这种方式既灵活又高效，有助于维护双方的合作关系。
- 法律途径：如果双方无法就建筑垃圾弃置费的计算方式达成一致，且合同中没有相关约定，那么任何一方均有权通过法律途径来解决争议。在这种情况下，法院或仲裁机构会根据相关法律法规、行业惯例以及双方提供的证据来作出裁决。
建议：
- 在签订合同时，双方应尽可能明确各项费用的计算方式，包括土方弃置费和建筑垃圾弃置费等，以避免后续产生争议。
- 如果合同中已有相关约定，但双方对约定内容存在理解上的分歧，建议及时沟通并寻求法律意见，以确保合同的正确执行。
- 在处理合同纠纷时，双方应保持冷静和理性，通过协商、调解等和平方式解决争议，以维护双方的合作关系和商业信誉。
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