物业公司车位服务协议是否需要备案，需分情况讨论：
若车位属于物业管理区域内的规划车位：
- 一般无需单独备案。根据《物业管理条例》及相关规定，物业服务合同（包含车位管理服务内容）通常需在物业所在地的房地产行政主管部门或街道办事处、乡镇人民政府备案。但此处的备案主要针对物业服务合同整体，而非单独的车位服务协议。若车位服务内容已涵盖在物业服务合同中，则无需就车位服务协议单独备案。
- 例外情况：若地方性法规或规章对车位服务协议有特别备案要求（如某些城市要求车位租赁合同备案），则需遵循当地规定。例如，若地方规定车位租赁需单独备案，则物业公司需按要求办理。
若车位属于人防车位或业主共有车位：
- 人防车位：根据《人民防空法》及地方实施细则，人防车位的使用需符合人防工程平时使用规定，但通常不涉及车位服务协议的备案问题。物业公司需确保使用符合规定，但协议本身无需备案。
- 业主共有车位：若车位属于业主共有（如通过业主大会决议划定的共有车位），物业公司受业主委员会委托管理时，车位服务协议的内容需经业主大会同意。此类协议的合法性主要依赖于业主大会的决议程序，而非行政备案。但若地方规定此类协议需备案，则需遵循。
法律建议：
- 核实地方规定：物业公司应首先查阅当地房地产行政主管部门或街道办事处、乡镇人民政府发布的备案要求，确认是否需对车位服务协议单独备案。
- 完善协议内容：无论是否需备案，车位服务协议均应明确服务内容、费用标准、违约责任等条款，避免纠纷。
- 保留证据：若协议需备案，物业公司应按要求提交材料并保留备案回执；若无需备案，也应妥善保存协议原件及履行记录，以备查验。
可能后果：
- 未备案的合规风险：若地方规定需备案而未备案，物业公司可能面临行政处罚（如罚款）或协议效力争议（如被认定为无效协议）。
- 协议瑕疵的纠纷风险：若协议内容不明确或未履行备案程序（如地方要求），可能导致业主与物业公司之间的纠纷，影响物业服务质量。
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