结论：针对“钱打在公司账上，有协议但没变更成股东”的情况，您需要采取一系列措施来维护自己的权益，包括确认协议内容、与公司沟通协商、考虑法律途径解决，并关注潜在的法律后果。以下是对这一问题的详细分析：

一、确认协议内容与性质

首先，您需要仔细审查与公司的协议内容，特别是关于出资、股权变更、股东权益等关键条款。协议是双方意思表示一致的产物，具有法律约束力。如果协议中明确规定了您出资后应成为公司股东，并享有相应的股东权益，那么公司未按照协议变更股东身份，就构成了违约。

二、与公司沟通协商

1. 书面催告：您可以向公司发出书面催告，要求公司按照协议约定办理股东变更登记手续。催告中应明确列出协议中的相关条款，以及公司未履行义务的具体事实和法律依据。
2. 协商解决方案：在催告的同时，您可以与公司协商解决方案，如公司承诺在一定期限内完成股东变更登记，或者提供其他形式的补偿。协商过程中，您可以要求公司出具书面承诺或协议，以确保双方权益得到保障。

三、考虑法律途径解决

如果与公司沟通协商无果，您可以考虑通过法律途径解决纠纷。具体来说：

1. 提起诉讼：您可以向法院提起诉讼，要求公司履行协议义务，办理股东变更登记手续。在诉讼过程中，您需要提供充分的证据证明协议的存在、内容以及公司未履行义务的事实。
2. 申请仲裁：如果协议中约定了仲裁条款，或者双方事后达成了仲裁协议，您还可以向仲裁机构申请仲裁。仲裁具有高效、灵活的特点，可以更快地解决纠纷。

四、关注潜在法律后果

1. 股东身份确认：如果最终通过法律途径确认了您的股东身份，您将享有公司股东的相应权益，如分红权、表决权等。同时，您也需要承担股东的义务，如出资义务、忠诚义务等。
2. 违约责任：如果公司未按照协议履行义务，除了需要办理股东变更登记手续外，还可能需要承担违约责任，如支付违约金、赔偿损失等。具体责任形式和金额将根据协议约定和法律规定确定。
3. 诉讼风险：提起诉讼或申请仲裁都存在一定的风险，如诉讼费用、时间成本、败诉风险等。因此，在决定采取法律途径前，您需要充分评估风险，并做好相应的准备。

五、建议与提醒

1. 保留证据：在整个过程中，您需要保留好与公司的协议、付款凭证、沟通记录等证据，以备不时之需。
2. 寻求专业帮助：由于涉及法律问题，建议您在处理过程中寻求专业律师的帮助，以确保您的权益得到充分保障。

如果您有任何进一步的疑问或需要更具体的法律建议，请直接向我咨询。