结论：是否合法需分情况讨论，关键在于留用地回购款的性质、分配方案是否符合法定程序及村民意愿。以下是具体分析：
1. 若留用地回购款属于集体收益，且分配方案经法定程序通过
根据《村民委员会组织法》第24条，涉及村民利益的重大事项（如土地补偿费的使用、分配方案）需经村民会议或村民代表会议民主讨论决定。若回购款属于集体经济组织收益（如留用地出租、转让后的收益），且分配方案经村民会议三分之二以上成员或三分之二以上村民代表同意，则发放行为合法。
关键点：需留存会议记录、表决结果等材料，证明分配程序合规。
2. 若回购款属于个人补偿款（如征地补偿中的安置补助费）
根据《土地管理法实施条例》第32条，征地补偿费用中的安置补助费应直接支付给被安置人员（如村民个人），而非集体分配。若村里将本应发放给个人的安置补助费截留后统一分配，则涉嫌违法，村民有权要求返还。
例外情形：若村民自愿放弃个人补偿，书面同意将款项纳入集体分配，则可能合法，但需严格履行书面确认程序。
3. 若分配方案未履行法定程序或存在不公
即使回购款属于集体收益，若分配方案未经民主讨论、未公开公示，或存在歧视性分配（如按户籍、性别等不合理标准分配），则违反《村民委员会组织法》第27条，村民可向乡镇政府反映，要求责令改正。
典型案例：部分村庄以“少数服从多数”为由强制分配，忽视少数村民异议，可能因程序违法被撤销。
行动建议
如有进一步细节（如回购款具体来源、分配方案内容），可继续向我咨询，我会结合具体情形为您分析。