针对职工债权未确认部分提起确认之诉后，已确认部分的处理方式如下：

1. 已确认部分效力不受影响
   根据《企业破产法》及相关司法解释，职工债权确认程序具有独立性。已通过管理人审核、债权人会议核查或法院裁定的确认部分，其债权金额、性质及清偿顺序已产生法律效力，不会因未确认部分提起诉讼而被动摇。即使后续未确认部分经诉讼被驳回或调整，已确认部分仍按原方案参与分配。

2. 已确认部分的清偿流程

   • 优先受偿权保障：职工债权（如工资、医疗伤残补助、抚恤费用等）属于破产财产分配中的第一顺序清偿，优先于普通债权。已确认部分应由管理人按破产财产分配方案直接清偿。
     
   • 清偿方式：若破产财产充足，管理人需全额支付；若不足，则按比例分配，但职工债权仍优先于其他债权受偿。
     
   • 异议处理：若债务人或其他债权人对已确认部分提出异议，需通过破产撤销权之诉或申请复议等程序解决，但不影响当前清偿流程的推进。

3. 未确认部分诉讼对已确认部分的影响

   • 诉讼结果独立性：未确认部分提起的确认之诉，仅针对该部分债权的真实性、金额或性质进行审查，不涉及已确认部分。例如，若职工主张总债权100万元，管理人确认80万元，对未确认的20万元提起诉讼，即使法院最终认定20万元不成立，已确认的80万元仍有效。
     
   • 补充清偿可能性：若未确认部分经诉讼被支持（如法院认定管理人漏审20万元），则该部分需按职工债权性质补充确认，并纳入后续分配方案，但已分配部分无需追回。

4. 实务建议

   • 及时行使权利：职工应在债权申报期限内完整申报债权，避免因逾期申报导致部分债权未被确认。
     
   • 保留证据：对未确认部分，需准备劳动合同、工资单、欠条等证据，以支持诉讼主张。
     
   • 关注分配方案：已确认部分的清偿时间、方式需以管理人制定的分配方案为准，职工可要求管理人提供书面说明。

总结：已确认的职工债权部分具有法律效力，可直接参与破产分配；未确认部分通过诉讼确认后，仅影响新增债权的处理，不影响已确认部分的清偿。如有进一步疑问，可直接向我咨询破产法相关问题。