公司租赁宅基地建房并顶租金的行为，其合法性需分情况讨论，主要取决于宅基地的使用权归属、租赁合同的效力以及建房行为的合规性。以下是对这一问题的详细分析：
一、宅基地使用权归属与租赁合同效力
宅基地使用权归属：
- 宅基地使用权是农村集体经济组织成员享有的权利，用于建造住宅及其附属设施。非集体经济组织成员（如公司）通常无权直接取得宅基地使用权。
- 如果公司通过租赁方式从宅基地使用权人（如农户）处获得宅基地的使用权，需确保租赁合同合法有效，且符合当地宅基地管理政策。
租赁合同效力：
- 租赁合同需双方自愿、平等、公平、诚实信用原则下签订，且内容不违反法律、行政法规的强制性规定。
- 若租赁合同违反宅基地管理政策（如非集体经济组织成员租赁宅基地），则可能被认定为无效合同。
二、建房行为的合规性
建房许可：
- 在宅基地上建房需取得相关行政许可，如乡村建设规划许可证、施工许可证等。
- 若公司未取得相应许可即擅自建房，则可能构成违法建设，面临拆除、罚款等法律后果。
建房用途与规划：
- 建房用途需符合宅基地的原始用途（即居住用途），不得擅自改变用途（如用于商业经营）。
- 建房需符合当地乡村规划，不得影响周边环境和公共利益。
三、顶租金行为的合法性
租金支付方式：
- 顶租金通常指以房屋或其他财产抵偿租金的行为。若租赁合同中明确约定了顶租金的方式和条件，且该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，则顶租金行为本身可能合法。
- 但需注意，顶租金行为不得损害其他债权人的利益，且需确保抵偿的财产价值与租金相当。
潜在风险：
- 若顶租金行为涉及非法财产（如违法建筑）或存在欺诈、胁迫等情形，则可能被认定为无效行为。
- 顶租金行为可能引发税务问题，如需缴纳相关税费而未缴纳，则可能面临税务处罚。
四、综合建议
审查租赁合同：
- 确保租赁合同合法有效，明确双方权利义务，特别是关于建房和顶租金的约定。
办理建房许可：
- 在建房前，务必取得相关行政许可，确保建房行为合规。
咨询当地政策：
- 了解当地宅基地管理政策和乡村规划要求，确保建房用途和规划符合规定。
谨慎处理顶租金行为：
- 确保顶租金行为合法合规，避免涉及非法财产或欺诈、胁迫等情形。
若公司租赁宅基地建房并顶租金的行为存在任何违法或不合规之处，可能面临合同无效、违法建设拆除、罚款等法律后果。因此，建议公司在进行此类行为前，务必咨询专业律师或相关政府部门，确保行为合法合规。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。