在个人证书上违法印制国徽，将面临行政处罚，具体由市场监督管理部门或公安机关进行处罚。以下从不同角度详细分析：
- 违法性质与处罚依据
根据《中华人民共和国国徽法》第十三条的规定，国徽及其图案不得用于：
- 商标、授予专利权的外观设计、商业广告；
- 日常用品、日常生活的陈设布置；
- 私人庆典活动；
- 其他不适宜使用国徽及其图案的场合。
在个人证书上违法印制国徽，显然属于不适宜使用国徽及其图案的场合，违反了上述法律规定。对于此类违法行为，将依据《中华人民共和国国徽法》第十八条进行处罚，即由公安机关给予警告或者一百元以下罚款。但需注意，若该行为同时构成违反治安管理行为的，如伪造、变造国徽等，将依据《中华人民共和国治安管理处罚法》的规定给予处罚，处罚措施包括警告、罚款、行政拘留等。
- 处罚部门
- 市场监督管理部门：如果个人证书的印制行为涉及到商业活动，如伪造、变造或非法买卖带有国徽的证书，且该行为同时违反了市场监管方面的法律法规，那么市场监督管理部门也有权依据相关法律法规进行处罚。不过，在大多数情况下，对于单纯在个人证书上违法印制国徽的行为，市场监督管理部门可能不是主要的处罚部门。
- 公安机关：如前所述，根据《中华人民共和国国徽法》第十八条的规定，对于在个人证书上违法印制国徽的行为，公安机关是主要的处罚部门。公安机关将依据违法行为的性质和情节，给予警告、罚款等行政处罚。如果行为构成犯罪，如伪造国家机关证件罪等，公安机关还将依法追究刑事责任。