老公和女儿做亲子鉴定并不违法。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、法律角度
隐私权与亲子鉴定：
- 隐私权是每个人的基本权利，受到法律的保护。然而，亲子鉴定通常是在涉及家庭关系、继承权、抚养权等法律争议时进行的，其目的在于确认或否认亲子关系，以解决法律纠纷。
- 在这种情况下，进行亲子鉴定并不构成对隐私权的侵犯，因为鉴定是为了解决法律争议，且通常是在双方同意或法院命令下进行的。
亲子鉴定的合法性：
- 亲子鉴定本身是一种科学手段，用于确定亲子关系的真实性。在我国，亲子鉴定是合法的，只要遵循相关的法律程序和规定。
- 如果老公和女儿之间存在亲子关系的疑问，且这种疑问影响到了家庭关系、继承权等法律权益，那么进行亲子鉴定是合法且合理的。
二、伦理角度
家庭关系与信任：
- 亲子鉴定可能会对家庭关系产生一定的影响，特别是当鉴定结果与预期不符时。因此，在进行亲子鉴定之前，应充分考虑家庭关系的稳定性和信任基础。
- 如果老公和女儿之间的亲子关系存在疑问，且这种疑问已经对家庭关系造成了负面影响，那么进行亲子鉴定可能是解决争议、恢复信任的一种途径。
尊重与理解：
- 在进行亲子鉴定时，应尊重每个人的感受和意愿。特别是对于女儿来说，她可能对亲子鉴定感到困惑、不安或抵触。因此，在进行鉴定之前，应与她进行充分的沟通，解释鉴定的目的和意义，以获得她的理解和配合。
三、实际操作角度
鉴定机构的选择：
- 在进行亲子鉴定时，应选择具有合法资质和良好信誉的鉴定机构。这样可以确保鉴定的准确性和可靠性，避免因为鉴定结果不准确而引发的法律纠纷。
鉴定程序的遵循：
- 亲子鉴定应遵循相关的法律程序和规定。例如，可能需要提供身份证明、同意书等文件，并按照鉴定机构的要求进行采样和检测。遵循正确的程序可以确保鉴定的合法性和有效性。
总结与建议：
老公和女儿做亲子鉴定并不违法，但应充分考虑法律、伦理和实际操作等多个角度的因素。如果决定进行亲子鉴定，应选择合法的鉴定机构，遵循正确的程序，并尊重每个人的感受和意愿。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的解答和帮助。