关于公司内部制度罚款的合法性，这是一个涉及法律法规、员工权益保护以及企业管理制度的复杂问题。以下是对此问题的详细分析：

一、公司罚款权的基本原则与法律背景

首先，我们需要明确的是，公司在一般情况下并不具备法律授予的行政处罚权。罚款，作为一种行政处罚行为，其行使主体是特定的行政机关，并且需要法律的明确授权。自2008年《企业职工奖惩条例》废止后，我国法律并未直接赋予企业罚款权。因此，从原则上讲，公司不能对员工进行直接罚款。

二、合法可能的“罚款”或经济处罚措施

尽管公司一般不能直接罚款，但在特定条件下，某些类似“罚款”的经济处罚措施可能具有合法性。这主要体现在以下两个方面：

1. 基于劳动合同的约定：

   • 如果劳动合同中明确规定了员工违反特定条款时需承担的经济责任，并且这些约定不违反法律法规的强制性规定，那么公司要求员工据此承担责任可能被认定为合法。例如，劳动合同中可以约定，因员工故意或重大过失给公司造成经济损失的，员工需按损失的一定比例进行赔偿。

2. 依据合法有效的规章制度：

   • 内容合法：公司规章制度中关于经济处罚的内容必须符合法律法规的规定，不得侵犯员工的合法权益。罚款金额必须合理，不能过高以至于显失公平或违反法律规定。
   • 程序合法：规章制度的制定需经过民主程序，即应经职工代表大会或全体职工讨论，提出方案和意见，并与工会或职工代表平等协商确定。同时，公司还需将规章制度公示或告知劳动者，确保员工知晓并理解其内容。

三、经济损失赔偿的限制

即使员工给公司造成了经济损失，公司在要求员工赔偿时也需遵守一定的限制。根据《工资支付暂行规定》，公司可从员工工资中扣除赔偿费用，但每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%。若扣除后的剩余工资低于当地月最低工资标准，则应按最低工资标准支付。

四、不合法罚款的情形与员工权益保护

如果公司的罚款行为存在以下情形，则可能被视为不合法：

• 规章制度未经民主程序制定或内容违法；
• 罚款缺乏事实依据，仅凭口头举报等无实质性证据即对员工进行罚款；
• 罚款金额过高，显失公平或违反法律规定。

员工在面对公司不合法罚款时，有权了解罚款的依据和理由，并可以通过以下途径维护自己的权益：

• 向劳动监察部门投诉，请求对公司的罚款行为进行审查；
• 咨询专业律师，了解自己的法律权益和可能的救济途径；
• 在必要时，可以向法院提起诉讼，通过司法程序维护自己的合法权益。

五、结论与建议

综上所述，公司内部制度罚款的合法性需根据具体情况判断。在符合特定条件下，如基于劳动合同约定或合法有效的规章制度，并采取合法合理的程序和经济损失赔偿限制，公司的“罚款”措施才可能具有合法性。因此，建议公司在制定内部罚款制度时，应确保制度的合法性、合理性及透明性，并严格按照法定程序执行。同时，员工也应了解自己的法律权益和救济途径，以便在必要时维护自己的合法权益。