结论前置：能否起诉需分情况讨论，主要取决于起诉目的和具体诉求。以下分情况详细说明：

1. 若起诉目的是确认婚姻无效或撤销婚姻
   根据《中华人民共和国民法典》第1051条，婚姻无效的情形包括“重婚、有禁止结婚的亲属关系、未到法定婚龄”，并不包括配偶无国籍或身份不合法。因此，若仅以“配偶身份不合法”为由起诉确认婚姻无效，法院通常不会支持。
   但若配偶存在伪造身份证明、冒用他人身份等欺诈行为，导致婚姻登记程序存在瑕疵，可依据《民法典》第1052条（因胁迫结婚）或第1053条（隐瞒重大疾病）主张撤销婚姻，但需注意“身份不合法”本身不直接等同于“胁迫”或“隐瞒疾病”，需结合具体证据判断。

2. 若起诉目的是解决身份关系衍生的其他问题

   • 抚养权/财产分割：即使配偶身份不合法，若双方已共同生活并生育子女，或存在共同财产，仍可就子女抚养、财产分割等问题起诉。法院会依据《民法典》婚姻家庭编的相关规定处理，但可能要求配偶补充身份证明或通过其他方式确认其诉讼主体资格。
     
   • 侵权赔偿：若配偶的身份不合法导致您遭受损失（如因配偶伪造身份导致您被行政处罚、经济损失等），可依据《民法典》侵权责任编起诉要求赔偿，此时需重点收集证据证明因果关系和损失金额。

3. 若起诉目的是要求行政机关纠正配偶的身份问题
   配偶的“身份不合法”可能涉及户籍、出入境管理等行政领域。若您认为行政机关未依法履行职责（如未及时注销配偶的虚假身份、未限制其非法居留等），可依据《行政诉讼法》提起行政诉讼，要求行政机关履行法定职责或撤销错误行政行为。但需注意，此类诉讼的原告通常是直接利害关系人（如您因配偶身份问题被牵连受罚），且需证明行政机关存在不作为或违法作为。

温馨提示：

• 起诉前建议先通过律师协助调查配偶的真实身份信息（如通过合法途径查询户籍、出入境记录等），以明确诉讼方向和证据需求。
  
• 若涉及跨国婚姻或无国籍人，还需考虑国际私法规则（如冲突规范）和对方国籍国法律，可能增加诉讼复杂度。
  

如有进一步疑问或需具体方案，可直接向我咨询，我会结合您的实际情况详细解答。