核心结论：当自家小狗被逆行摩托车撞后，可按以下步骤处理：先确保现场安全并收集证据，接着与对方协商赔偿，协商不成可寻求第三方调解，若仍无法解决则考虑通过法律途径维权。以下是详细说明：

1. 确保现场安全并收集证据
   • 确保安全：在事故发生后，首先要确保自身和小狗的安全。如果小狗受伤严重，应立即将其送往附近的宠物医院进行救治，同时注意自身在现场的安全，避免二次事故的发生。
   • 收集证据：尽可能收集与事故相关的证据，这是后续维权的关键。证据包括但不限于现场照片，拍摄事故现场的全貌、摩托车逆行的位置、小狗受伤的情况等；寻找目击证人，询问他们的联系方式，以便后续需要时请他们作证；如果可能的话，调取附近的监控录像，这能更直观地证明事故的发生经过和责任归属。
2. 与对方协商赔偿
   • 明确责任：根据《中华人民共和国道路交通安全法》的规定，机动车逆行属于违法行为，在此次事故中，摩托车驾驶者应承担主要或全部责任。在协商时，要明确向对方指出其逆行的违法行为以及应承担的责任。
   • 确定赔偿范围：赔偿范围主要包括小狗的治疗费用，包括医疗费、药品费等；如果小狗因事故导致残疾或死亡，还可能涉及残疾赔偿金或死亡赔偿金（不过对于宠物而言，死亡赔偿金在法律上可能没有明确规定，但可以基于宠物的价值、与主人的情感等因素与对方协商）；此外，还可能包括因照顾受伤小狗而产生的误工费等合理费用。
   • 协商过程：与对方进行友好、理性的协商，尽量达成一个双方都能接受的赔偿协议。在协商过程中，要保持冷静，避免情绪激动导致协商破裂。如果对方态度诚恳，愿意承担责任并进行赔偿，可以签订一份简单的赔偿协议，明确赔偿金额、支付方式、支付时间等条款。
3. 寻求第三方调解
   • 调解机构：如果与对方协商不成，可以寻求第三方的调解。可以选择当地的社区调解委员会、人民调解委员会等机构进行调解。这些机构具有中立性和专业性，能够帮助双方客观地分析问题，提出合理的解决方案。
   • 调解过程：在调解过程中，要如实向调解员陈述事故的经过和自己的诉求，同时也要听取对方的意见和理由。调解员会根据双方的陈述和提供的证据，进行调解和劝说，促使双方达成调解协议。如果调解成功，双方应签订调解协议书，该协议书具有法律效力，双方应按照协议履行各自的义务。
4. 通过法律途径维权
   • 起诉条件：如果经过协商和调解都无法解决问题，可以考虑通过法律途径维权。起诉的条件包括有明确的被告，即知道摩托车驾驶者的身份信息；有具体的诉讼请求和事实、理由，即明确要求对方赔偿的金额和依据；属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。
   • 起诉流程：准备好起诉状和相关证据材料，向有管辖权的人民法院提起诉讼。法院受理案件后，会安排开庭审理。在庭审过程中，要如实陈述事实，提供证据，维护自己的合法权益。法院会根据双方的陈述和证据，作出判决。如果对方不履行判决，可以申请法院强制执行。