核心结论：妻子逾期但已还清的情况下，一般可以让贷款公司开具结清证明，但能否开具非恶意逾期证明存在不确定性，且这两份证明对丈夫公积金贷款的影响需分情况讨论。

1. 关于开具证明的可能性

   • 结清证明：妻子已经还清了逾期贷款，从常规操作来看，贷款公司是有义务为借款人开具结清证明的。结清证明是证明贷款已经全额偿还完毕的重要文件，只要妻子按照贷款合同约定完成了还款义务，向贷款公司提出开具结清证明的合理请求，贷款公司通常会予以配合。
   • 非恶意逾期证明：能否开具非恶意逾期证明则存在一定难度。这需要妻子能够提供充分的证据证明逾期并非出于主观恶意，比如是因为一些不可抗力因素（如突发重大疾病、意外事故等导致暂时失去还款能力）或者是一些客观原因（如银行系统故障导致还款未能及时到账等）。如果妻子无法提供这些有力的证据，贷款公司可能不会轻易开具非恶意逾期证明，因为这涉及到对逾期原因的认定和责任划分，贷款公司需要谨慎对待以避免潜在的法律风险。

2. 对丈夫公积金贷款的影响

   • 若能开具两份证明：如果妻子成功开具了结清证明和非恶意逾期证明，那么在一定程度上可以减轻逾期记录对丈夫公积金贷款的不利影响。公积金贷款审批时，会综合考虑夫妻双方的信用状况。妻子提供了这两份证明，说明逾期情况已经得到解决且并非恶意，贷款机构可能会更倾向于认为夫妻双方整体信用风险较低，从而对丈夫的公积金贷款审批产生积极影响，提高贷款审批通过的可能性。
   • 若只能开具结清证明：即使只能开具结清证明，也能表明妻子的贷款已经还清，在一定程度上向贷款机构展示了还款能力和还款意愿。不过，由于缺乏非恶意逾期证明，逾期记录仍然可能会对丈夫的公积金贷款产生一定的负面影响。贷款机构在审批时可能会更加谨慎，可能会要求丈夫提供更多的收入证明、资产证明等材料，以评估其还款能力和信用风险，甚至可能会提高贷款利率或者降低贷款额度。
   • 若无法开具任何证明：如果妻子既无法开具结清证明也无法开具非恶意逾期证明，那么逾期记录将会对丈夫的公积金贷款产生较为明显的不利影响。贷款机构在审批时会将夫妻双方的信用状况作为一个整体来考量，妻子的逾期记录可能会被视为夫妻双方信用风险较高的表现，从而增加丈夫公积金贷款审批的难度，可能导致贷款申请被拒绝或者获得不利的贷款条件。

在实际操作中，建议妻子先与贷款公司积极沟通，尽量争取开具结清证明和非恶意逾期证明。同时，丈夫在申请公积金贷款时，要提前了解贷款机构的具体要求和审批标准，准备好充分的材料，以提高贷款申请的成功率。如果还有其他疑问，欢迎直接向我咨询。