结论：农村村民在有宅基证的宅基地上建库房存放粮食和农机具但未批先建，这一行为一般是不合法的。以下从多个角度进行分析：
一、法律角度
宅基地使用规定：
- 根据《土地管理法》及相关规定，宅基地是农村村民用于建造住宅及其附属设施的集体建设用地，包括住房、附属用房和庭院等用地。宅基地的使用需遵循严格的审批程序，村民在宅基地上建房或进行其他建设活动，必须事先获得相关部门的批准。
未批先建的法律后果：
- 未批先建属于违法行为，可能面临责令停止建设、限期改正、罚款等行政处罚。如果建设活动严重违反规划或影响他人权益，还可能面临更严厉的法律后果，如强制拆除等。
二、实践角度
审批流程的重要性：
- 审批流程是确保建设活动合法、合规的重要环节。通过审批，相关部门可以对建设项目的规划、设计、安全等方面进行审查，确保建设活动符合法律法规和规划要求。未批先建则绕过了这一环节，增加了违法风险和安全隐患。
村民权益保护：
- 虽然村民拥有宅基地的使用权，但这一权利并非无限制的。村民在行使宅基地使用权时，必须遵守法律法规和规划要求，不得损害他人权益或公共利益。未批先建可能侵犯他人权益或破坏公共利益，因此是不被允许的。
三、建议与措施
立即停止建设活动：
- 如果村民已经开始了未批先建的建设活动，应立即停止，并尽快向相关部门申请补办审批手续。在补办审批手续期间，应保持建设现场的稳定，避免扩大违法后果。
积极配合相关部门调查处理：
- 如果相关部门已经发现了未批先建的行为，村民应积极配合调查处理工作，如实说明情况，提供相关证据材料。通过积极配合，可以争取从轻或减轻处罚。
加强法律意识和规划意识：
- 村民应加强法律意识和规划意识，了解宅基地使用的相关法律法规和规划要求。在建设活动前，应提前咨询相关部门或专业人士的意见，确保建设活动合法、合规。
后续行动建议：如果您或您身边的村民有类似情况，建议立即停止建设活动，并尽快向当地土地管理部门或规划部门咨询补办审批手续的具体流程和要求。同时，也可以向我咨询相关法律问题，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议。