通过第三方进行违建并签订协议，这种行为是违法的。以下从几个角度详细分析这一问题：

1. 违建行为的违法性：

   • 违建，即未经规划、建设等行政主管部门批准，擅自搭建的建筑物或构筑物。这种行为违反了《城乡规划法》等相关法律法规，属于违法行为。违建不仅可能面临被拆除的风险，还可能对公共安全、城市规划等造成不良影响。

2. 签订协议的效力问题：

   • 即使双方通过第三方签订了关于违建的协议，该协议也因内容违法而无效。根据《民法典》的相关规定，违反法律、行政法规的强制性规定的民事法律行为无效。因此，这种协议无法得到法律的保护，一旦发生纠纷，双方都无法依据协议主张权利。

3. 法律责任与后果：

   • 对于违建行为，相关行政主管部门有权责令停止建设、限期拆除，并可以处以罚款。如果违建行为造成了他人损害，还可能面临民事赔偿的责任。此外，如果违建行为构成犯罪，如非法占用农用地罪等，还可能承担刑事责任。
   • 对于签订违法协议的行为，虽然协议本身无效，但双方可能因协议的签订和履行而产生其他法律纠纷，如因违约而产生的损失赔偿等。然而，这些纠纷的处理都将基于协议无效的前提进行。

4. 实际操作中的风险：

   • 在实际操作中，通过第三方进行违建并签订协议往往涉及复杂的利益关系和法律风险。第三方可能涉及违法行为的共谋或帮助，一旦被发现，也可能面临法律责任。同时，违建行为本身的不确定性（如是否被拆除、何时被拆除等）也给双方带来了极大的风险。

建议：

• 遵守法律法规，不要进行违建行为。如果需要进行建设活动，应依法办理相关手续，确保建设行为的合法性。
• 如果已经签订了关于违建的协议，应尽快与对方协商解除协议，并妥善处理因协议而产生的相关事宜。
• 如果遇到违建相关的法律纠纷或问题，应及时咨询专业律师，以便得到专业的法律建议和帮助。

总之，通过第三方进行违建并签订协议是违法的，不仅无法得到法律的保护，还可能面临严重的法律后果。因此，建议遵守法律法规，不要进行违建行为。如有任何法律问题或疑虑，可以直接向我咨询。