结论：材料补正信息被否但案件仍立案，可能存在多种原因，包括补正材料非必要材料、立案审查标准宽松、立案后发现材料问题或存在特殊情形等。以下是对这些可能原因的详细分析：
补正材料并非必要材料：
- 在政府信息公开申请中，如果申请人提交的材料存在某些瑕疵或不足，行政机关可能会要求申请人进行补正。然而，如果补正的材料并非决定是否立案的关键性材料，或者行政机关在审查时认为即使不补正也不影响案件的受理，那么即使补正信息被否，案件仍然可能会被立案。
立案审查标准相对宽松：
- 不同的行政机关或法院在立案审查时可能存在不同的标准。有些机关可能更注重实质内容的审查，而相对宽松地对待形式上的瑕疵。因此，即使补正信息被否，只要案件本身符合立案的实质条件，如属于行政机关的职责范围、有明确的申请人和被申请人、有具体的请求和事实根据等，案件仍然可能会被立案。
立案后发现材料问题：
- 另一种可能是，行政机关在初步审查时认为材料基本符合要求，因此决定立案。但在立案后的进一步审查过程中，发现补正的材料存在问题或不符合规定。这种情况下，虽然案件已经立案，但行政机关可能会在后续程序中要求申请人进一步补正材料或采取其他措施。
存在特殊情形：
- 在某些特殊情况下，如涉及公共利益、紧急情况或法律另有规定等，行政机关可能会在补正信息被否的情况下仍然决定立案。这是为了保障公共利益或应对紧急情况而采取的特殊措施。
法律建议：
- 如果您对案件立案的具体原因有疑问，建议您直接联系受理案件的行政机关或法院，了解立案的具体依据和理由。
- 同时，您也可以检查自己提交的材料是否确实存在瑕疵或不足，并考虑是否需要进一步补正或完善。
- 如果您认为行政机关或法院的立案决定存在错误或不当之处，您可以依法提出异议或申请复议。
可能后果：
- 如果补正材料确实存在问题且影响案件受理的，行政机关或法院可能会在后续程序中要求您进一步补正材料或采取其他措施。
- 如果您未能在规定时间内补正材料或采取其他措施的，可能会导致案件被驳回或撤销立案等后果。
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