结论概述：劳动监察限期整改通知书移交公安后的处理与工人直接起诉存在显著差异，主要体现在处理主体、处理程序、法律后果及对工人权益的影响上。以下是对这两种方式的详细分析。
一、劳动监察限期整改通知书移交公安后的处理
处理主体与程序：
- 当劳动监察部门发现用人单位存在严重违反劳动法律法规的行为，且可能构成犯罪时，会将案件移交公安机关处理。
- 公安机关在接收案件后，会进行立案侦查，收集证据，查明事实真相。
- 若证据确凿，公安机关会依法对用人单位或相关责任人采取刑事强制措施，如拘留、逮捕等，并可能提起公诉。
法律后果：
- 用人单位或相关责任人可能面临刑事处罚，如罚金、拘役、有期徒刑等。
- 这种处理方式对用人单位的声誉和信用造成严重影响，可能引发社会舆论的谴责。
对工人权益的影响：
- 工人可能通过刑事附带民事诉讼的方式，要求用人单位赔偿因违法行为造成的损失。
- 刑事处罚的严厉性可能促使用人单位更加重视劳动法律法规的遵守，从而间接保护工人的合法权益。
二、工人直接起诉
处理主体与程序：
- 工人可以直接向人民法院提起民事诉讼，要求用人单位承担民事责任。
- 法院在接收案件后，会进行审理，查明事实真相，并依法作出判决。
- 工人需要提供充分的证据来支持自己的诉讼请求，如劳动合同、工资单、工作记录等。
法律后果：
- 若法院判决用人单位承担民事责任，用人单位需要按照判决结果履行赔偿义务。
- 工人可以通过法律途径维护自己的合法权益，获得应有的赔偿。
对工人权益的影响：
- 直接起诉为工人提供了一种直接、有效的维权方式，无需依赖劳动监察部门或公安机关的介入。
- 工人可以根据自己的意愿和实际情况选择起诉的时机和方式，更加灵活地维护自己的权益。
三、两种方式的比较与选择
处理效率与成本：
- 劳动监察限期整改通知书移交公安后，处理过程可能较为漫长，且涉及刑事侦查和审判程序，成本较高。
- 工人直接起诉则相对灵活，可以根据自己的情况选择起诉的时机和方式，但也需要承担一定的诉讼成本和时间成本。
法律后果的严重性：
- 劳动监察限期整改通知书移交公安后，用人单位可能面临刑事处罚，后果较为严重。
- 工人直接起诉则主要涉及民事赔偿，后果相对较轻。
选择建议：
- 若用人单位的违法行为严重且可能构成犯罪，工人可以考虑向劳动监察部门举报，并推动案件移交公安机关处理。
- 若工人希望快速解决纠纷并获得赔偿，且证据充分，可以直接向人民法院提起民事诉讼。
总结与建议：劳动监察限期整改通知书移交公安后的处理与工人直接起诉在处理主体、处理程序、法律后果及对工人权益的影响上存在显著差异。工人应根据自己的实际情况和需求选择合适的维权方式。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。